More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2674 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  67.6 
 
 		 857 aa  1198    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  64.09 
 
 		 870 aa  1108    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  67.19 
 
 		 832 aa  1152    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 866 aa  1788    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  67.31 
 
 		 887 aa  1156    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  37.21 
 
 		 915 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 831 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  37.41 
 
 		 914 aa  519  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.7 
 
 		 814 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  35.79 
 
 		 823 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  36.64 
 
 		 845 aa  468  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 820 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  34.63 
 
 		 851 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  34.47 
 
 		 843 aa  436  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  34.26 
 
 		 913 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  34.06 
 
 		 913 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  34.64 
 
 		 836 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  34.69 
 
 		 839 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  35.17 
 
 		 833 aa  429  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  33.41 
 
 		 913 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.53 
 
 		 818 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  33.33 
 
 		 897 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.36 
 
 		 839 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  33.14 
 
 		 884 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  33.88 
 
 		 843 aa  418  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  32.49 
 
 		 838 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  33.17 
 
 		 850 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.87 
 
 		 734 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  48.56 
 
 		 738 aa  396  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  32.95 
 
 		 906 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  32.63 
 
 		 852 aa  382  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.01 
 
 		 813 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  45.03 
 
 		 745 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  33.73 
 
 		 772 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.84 
 
 		 711 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 927 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  48.07 
 
 		 721 aa  362  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  32.3 
 
 		 832 aa  361  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.24 
 
 		 874 aa  359  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.6 
 
 		 904 aa  357  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.87 
 
 		 966 aa  354  5e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  32.01 
 
 		 738 aa  344  4e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  31.88 
 
 		 738 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  31.97 
 
 		 805 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  31.63 
 
 		 897 aa  329  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.6 
 
 		 927 aa  298  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.49 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  29.62 
 
 		 875 aa  293  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.37 
 
 		 886 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.2 
 
 		 988 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  29.27 
 
 		 902 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.12 
 
 		 893 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  29.07 
 
 		 864 aa  274  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  29.4 
 
 		 882 aa  261  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.42 
 
 		 749 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.42 
 
 		 758 aa  259  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  45.91 
 
 		 755 aa  257  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.44 
 
 		 755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  40.39 
 
 		 762 aa  255  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  41.71 
 
 		 740 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 		 757 aa  249  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.63 
 
 		 757 aa  248  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  38.44 
 
 		 800 aa  248  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.76 
 
 		 751 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  45.49 
 
 		 747 aa  247  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  26.76 
 
 		 972 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.22 
 
 		 820 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.33 
 
 		 790 aa  238  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.84 
 
 		 748 aa  236  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  36.64 
 
 		 749 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.64 
 
 		 497 aa  236  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  28.87 
 
 		 898 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  30 
 
 		 578 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  29.29 
 
 		 928 aa  228  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.01 
 
 		 750 aa  227  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  35.26 
 
 		 721 aa  227  7e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.12 
 
 		 750 aa  227  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 		 760 aa  227  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  38.94 
 
 		 685 aa  225  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  41.85 
 
 		 737 aa  225  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  37.57 
 
 		 757 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.43 
 
 		 722 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  38.23 
 
 		 730 aa  222  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  35.71 
 
 		 731 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.78 
 
 		 717 aa  222  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 		 813 aa  221  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.34 
 
 		 814 aa  220  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.56 
 
 		 809 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.89 
 
 		 824 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  33.56 
 
 		 701 aa  214  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  40.23 
 
 		 716 aa  211  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  28.02 
 
 		 849 aa  211  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.27 
 
 		 777 aa  211  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.73 
 
 		 708 aa  211  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.7 
 
 		 741 aa  210  9e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.35 
 
 		 756 aa  210  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.68 
 
 		 737 aa  208  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  38.35 
 
 		 748 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  32.74 
 
 		 714 aa  205  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>