More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51227 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  46.41 
 
 
850 aa  744    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  48.18 
 
 
833 aa  798    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  46.64 
 
 
838 aa  765    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  42.74 
 
 
915 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  70.04 
 
 
851 aa  1241    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  54.4 
 
 
738 aa  809    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  53.82 
 
 
839 aa  904    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  54.53 
 
 
738 aa  812    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  89.44 
 
 
843 aa  1540    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  100 
 
 
843 aa  1728    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  42.35 
 
 
914 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.11 
 
 
814 aa  634  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  40.32 
 
 
852 aa  589  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  38.22 
 
 
823 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  39.7 
 
 
845 aa  566  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.77 
 
 
820 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  43.46 
 
 
578 aa  507  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  35.24 
 
 
836 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 
831 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  34.47 
 
 
866 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  33.14 
 
 
870 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  32.43 
 
 
857 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.05 
 
 
818 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  33.81 
 
 
832 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
832 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  32.13 
 
 
913 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  31.7 
 
 
913 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  32.29 
 
 
887 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 
813 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  31.9 
 
 
805 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.19 
 
 
820 aa  361  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  30.77 
 
 
897 aa  347  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.56 
 
 
839 aa  336  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.14 
 
 
874 aa  332  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  30.28 
 
 
906 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  30.41 
 
 
897 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  29.94 
 
 
884 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 
913 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  29.25 
 
 
816 aa  313  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  30.38 
 
 
772 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  29.94 
 
 
927 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.69 
 
 
966 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  39.81 
 
 
716 aa  296  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  40.05 
 
 
755 aa  291  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.8 
 
 
749 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.8 
 
 
758 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.71 
 
 
886 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.26 
 
 
755 aa  277  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 
762 aa  275  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  41.34 
 
 
721 aa  275  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  27.92 
 
 
904 aa  273  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  40.61 
 
 
757 aa  272  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.43 
 
 
790 aa  261  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.01 
 
 
757 aa  260  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  38.58 
 
 
800 aa  260  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  36.05 
 
 
749 aa  260  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.97 
 
 
813 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  38.6 
 
 
747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.61 
 
 
750 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.33 
 
 
751 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  27.36 
 
 
881 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  27.86 
 
 
875 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.78 
 
 
750 aa  248  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  27.66 
 
 
893 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  43.68 
 
 
737 aa  244  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  37.23 
 
 
741 aa  239  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  26.88 
 
 
864 aa  238  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  25.75 
 
 
882 aa  237  7e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  35.59 
 
 
721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.82 
 
 
809 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.27 
 
 
711 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.86 
 
 
748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  32.85 
 
 
745 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  25.63 
 
 
882 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  35.1 
 
 
722 aa  234  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  34.24 
 
 
717 aa  234  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.73 
 
 
780 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.75 
 
 
497 aa  230  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  34.65 
 
 
714 aa  230  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 
734 aa  229  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  35.6 
 
 
740 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.8 
 
 
777 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.31 
 
 
814 aa  228  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 
742 aa  227  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 
757 aa  226  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  35.4 
 
 
738 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  28.84 
 
 
895 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  27 
 
 
889 aa  218  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  27.78 
 
 
902 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.11 
 
 
701 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  44.44 
 
 
765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  38.57 
 
 
760 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.69 
 
 
731 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  34.68 
 
 
793 aa  211  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  33.7 
 
 
874 aa  210  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.96 
 
 
922 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  34.68 
 
 
793 aa  210  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  34.96 
 
 
549 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  33.96 
 
 
731 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  35.12 
 
 
731 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>