More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1307 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  63.47 
 
 		 857 aa  1127    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  61.54 
 
 		 870 aa  1084    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  63.92 
 
 		 832 aa  1097    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  67.43 
 
 		 866 aa  1159    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  100 
 
 		 887 aa  1831    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  38.13 
 
 		 914 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  36.82 
 
 		 915 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  35.39 
 
 		 831 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.44 
 
 		 814 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.05 
 
 		 820 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  33.65 
 
 		 823 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  34.46 
 
 		 845 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  32.64 
 
 		 839 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  32.4 
 
 		 833 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.63 
 
 		 818 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.41 
 
 		 839 aa  416  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  32.79 
 
 		 851 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  32.95 
 
 		 913 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  32.37 
 
 		 913 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  31.24 
 
 		 838 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  31.8 
 
 		 897 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 913 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  48.74 
 
 		 738 aa  396  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  32.4 
 
 		 843 aa  392  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30.53 
 
 		 884 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  31.85 
 
 		 836 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.95 
 
 		 820 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  32.23 
 
 		 850 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  32 
 
 		 906 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.44 
 
 		 734 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  31.32 
 
 		 843 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  47.34 
 
 		 745 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.56 
 
 		 711 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 		 813 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  32.13 
 
 		 832 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  33.51 
 
 		 772 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.29 
 
 		 874 aa  353  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  46.84 
 
 		 721 aa  353  8e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  30.81 
 
 		 852 aa  348  3e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  31.4 
 
 		 738 aa  348  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  30.94 
 
 		 738 aa  347  8e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  32.22 
 
 		 805 aa  343  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  32.29 
 
 		 927 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.49 
 
 		 904 aa  332  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.59 
 
 		 966 aa  327  6e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  29.3 
 
 		 875 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  29.09 
 
 		 897 aa  303  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.49 
 
 		 886 aa  295  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 894 aa  293  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.86 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  28.07 
 
 		 816 aa  281  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.22 
 
 		 927 aa  280  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.51 
 
 		 749 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.31 
 
 		 758 aa  265  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 757 aa  255  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.04 
 
 		 988 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  28.05 
 
 		 882 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  27.75 
 
 		 882 aa  251  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  27.21 
 
 		 893 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  36.02 
 
 		 731 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  28.54 
 
 		 889 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 		 755 aa  241  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.47 
 
 		 757 aa  241  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  26.59 
 
 		 864 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  35.16 
 
 		 762 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  38.87 
 
 		 740 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.95 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.06 
 
 		 750 aa  232  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.28 
 
 		 746 aa  231  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  36.55 
 
 		 749 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.32 
 
 		 748 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  36.03 
 
 		 800 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.4 
 
 		 497 aa  227  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  27.01 
 
 		 902 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.91 
 
 		 747 aa  223  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  38.06 
 
 		 760 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  34.81 
 
 		 721 aa  219  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.9 
 
 		 750 aa  219  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  37.01 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  28.38 
 
 		 578 aa  217  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  37.05 
 
 		 733 aa  217  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  37.05 
 
 		 733 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  37.05 
 
 		 733 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  37.05 
 
 		 733 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  35.49 
 
 		 814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  37.05 
 
 		 733 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  37.43 
 
 		 748 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  34 
 
 		 722 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  37.31 
 
 		 733 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.62 
 
 		 813 aa  214  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  37.2 
 
 		 751 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  37.2 
 
 		 751 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  36.97 
 
 		 751 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  37.11 
 
 		 748 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  36.75 
 
 		 779 aa  210  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  36.49 
 
 		 748 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  36.79 
 
 		 733 aa  210  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>