More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3058 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  63.86 
 
 		 870 aa  1138    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  63.65 
 
 		 832 aa  1101    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  67.6 
 
 		 866 aa  1198    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  63.36 
 
 		 887 aa  1125    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  100 
 
 		 857 aa  1774    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.92 
 
 		 814 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  36.18 
 
 		 914 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 		 831 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  36.7 
 
 		 915 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  35.01 
 
 		 823 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.37 
 
 		 820 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  33.72 
 
 		 913 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  35.73 
 
 		 845 aa  438  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  33.14 
 
 		 913 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  32.5 
 
 		 838 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  31.83 
 
 		 897 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.42 
 
 		 839 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 913 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  32.3 
 
 		 839 aa  418  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  33.07 
 
 		 906 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  32.21 
 
 		 884 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  31.99 
 
 		 851 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  32.53 
 
 		 833 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  33.53 
 
 		 836 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  32.43 
 
 		 843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.34 
 
 		 818 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.57 
 
 		 820 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.56 
 
 		 734 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  44.92 
 
 		 738 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  30.84 
 
 		 843 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  33.68 
 
 		 772 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.05 
 
 		 813 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  32.94 
 
 		 832 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  31.66 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.29 
 
 		 711 aa  366  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  45.45 
 
 		 721 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  42.92 
 
 		 745 aa  361  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 		 874 aa  360  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.93 
 
 		 904 aa  354  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 		 927 aa  350  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  31.67 
 
 		 738 aa  347  6e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  32.03 
 
 		 738 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  29.22 
 
 		 852 aa  343  5.999999999999999e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  32.5 
 
 		 805 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  30.93 
 
 		 897 aa  333  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  30.24 
 
 		 966 aa  332  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  29.62 
 
 		 816 aa  310  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  29.12 
 
 		 875 aa  306  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.88 
 
 		 988 aa  296  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.6 
 
 		 927 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  29.59 
 
 		 882 aa  280  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 894 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  29 
 
 		 882 aa  273  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  29.47 
 
 		 902 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  27.98 
 
 		 886 aa  273  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29 
 
 		 881 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  29.52 
 
 		 889 aa  266  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.5 
 
 		 749 aa  265  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.5 
 
 		 758 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.21 
 
 		 755 aa  260  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.94 
 
 		 757 aa  251  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  36.01 
 
 		 762 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  26.34 
 
 		 972 aa  248  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.66 
 
 		 751 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  38.9 
 
 		 740 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  37.21 
 
 		 800 aa  244  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  33.91 
 
 		 731 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  38.85 
 
 		 749 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 		 757 aa  243  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.03 
 
 		 893 aa  242  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.28 
 
 		 497 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.64 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  42.86 
 
 		 747 aa  238  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  28.97 
 
 		 898 aa  238  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.44 
 
 		 748 aa  236  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  26.08 
 
 		 864 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.76 
 
 		 746 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.69 
 
 		 750 aa  231  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.81 
 
 		 813 aa  230  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  37.15 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  36.84 
 
 		 748 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  37.08 
 
 		 814 aa  227  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  31.04 
 
 		 895 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  37.93 
 
 		 748 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  29.21 
 
 		 849 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.65 
 
 		 757 aa  221  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  36.46 
 
 		 760 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  39.25 
 
 		 685 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  36.97 
 
 		 733 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  36.97 
 
 		 733 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  37.23 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  37.5 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  37.23 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  37.23 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  27.14 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.58 
 
 		 717 aa  216  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.02 
 
 		 809 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.7 
 
 		 750 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.79 
 
 		 777 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>