More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4152 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
831 aa  1706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  42.03 
 
 
915 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  42.16 
 
 
914 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  37.85 
 
 
913 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  38.28 
 
 
913 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.19 
 
 
814 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  36.81 
 
 
823 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  38.03 
 
 
906 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  36.02 
 
 
866 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  36 
 
 
857 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.64 
 
 
820 aa  515  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  36.37 
 
 
884 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  36.45 
 
 
870 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  36.24 
 
 
897 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 
913 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  36.06 
 
 
832 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  36.5 
 
 
845 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  35.39 
 
 
887 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  36.63 
 
 
836 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  37.35 
 
 
772 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  35.24 
 
 
838 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.33 
 
 
839 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  34.45 
 
 
843 aa  462  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  33.98 
 
 
851 aa  451  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  34.33 
 
 
843 aa  446  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.54 
 
 
904 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  34.3 
 
 
839 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  33.74 
 
 
833 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  35.94 
 
 
897 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  34.57 
 
 
966 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.28 
 
 
818 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  33.7 
 
 
850 aa  406  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  34.04 
 
 
738 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  34.04 
 
 
738 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  34.41 
 
 
927 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  34.41 
 
 
832 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  31.16 
 
 
886 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  32.01 
 
 
882 aa  359  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  31.9 
 
 
882 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  31.37 
 
 
852 aa  356  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.76 
 
 
889 aa  355  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 
813 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 
874 aa  353  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  33.55 
 
 
816 aa  352  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  33.21 
 
 
805 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.61 
 
 
875 aa  343  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.69 
 
 
757 aa  328  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  30.58 
 
 
902 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.94 
 
 
734 aa  317  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.93 
 
 
749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.19 
 
 
758 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  28.95 
 
 
864 aa  314  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  29.21 
 
 
893 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  31.81 
 
 
881 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  44.16 
 
 
760 aa  307  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.34 
 
 
755 aa  300  9e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.93 
 
 
757 aa  299  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.33 
 
 
711 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  40.92 
 
 
755 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  40.1 
 
 
745 aa  290  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  38.42 
 
 
721 aa  290  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  39.53 
 
 
762 aa  287  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  42.35 
 
 
740 aa  287  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.6 
 
 
751 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.25 
 
 
578 aa  283  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  40.44 
 
 
747 aa  276  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  30.87 
 
 
898 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.5 
 
 
741 aa  271  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  39.9 
 
 
800 aa  271  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 
750 aa  270  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  37.67 
 
 
738 aa  270  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.57 
 
 
750 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  31.05 
 
 
849 aa  264  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.01 
 
 
790 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.59 
 
 
748 aa  264  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  39.31 
 
 
749 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.93 
 
 
731 aa  260  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.4 
 
 
777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.25 
 
 
813 aa  256  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  37.74 
 
 
793 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  37.5 
 
 
793 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.84 
 
 
746 aa  253  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 
780 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  39.07 
 
 
721 aa  248  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.79 
 
 
737 aa  248  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.11 
 
 
809 aa  247  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  38.05 
 
 
722 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.97 
 
 
716 aa  244  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  37.37 
 
 
757 aa  243  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  37.95 
 
 
685 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.12 
 
 
742 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  38.78 
 
 
733 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  29.54 
 
 
934 aa  243  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  38.78 
 
 
733 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  38.78 
 
 
733 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  38.78 
 
 
733 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  38.78 
 
 
733 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  39.89 
 
 
733 aa  240  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  39.69 
 
 
987 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.01 
 
 
1072 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>