More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1945 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.92 
 
 
750 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  46.22 
 
 
762 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.59 
 
 
751 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.47 
 
 
777 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  46.29 
 
 
750 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  45.98 
 
 
755 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.78 
 
 
755 aa  636    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  100 
 
 
757 aa  1555    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  48.9 
 
 
760 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.22 
 
 
749 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.37 
 
 
758 aa  626  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  46.88 
 
 
740 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.55 
 
 
742 aa  595  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.02 
 
 
758 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.43 
 
 
757 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  44.73 
 
 
800 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  42.12 
 
 
747 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.97 
 
 
737 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.32 
 
 
741 aa  568  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.21 
 
 
748 aa  565  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.85 
 
 
790 aa  566  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  44.96 
 
 
749 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.84 
 
 
737 aa  550  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  44.61 
 
 
874 aa  538  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.81 
 
 
809 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.73 
 
 
813 aa  490  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 
780 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  39.14 
 
 
793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  39.14 
 
 
793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.04 
 
 
745 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.66 
 
 
734 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  34.54 
 
 
721 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  39.29 
 
 
701 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.51 
 
 
717 aa  415  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.82 
 
 
738 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.92 
 
 
814 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.81 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.07 
 
 
711 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.5 
 
 
721 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.5 
 
 
722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.51 
 
 
714 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  34.38 
 
 
716 aa  376  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.51 
 
 
757 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.04 
 
 
731 aa  351  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.74 
 
 
731 aa  340  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.55 
 
 
922 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.6 
 
 
987 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.46 
 
 
731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 
933 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.03 
 
 
1072 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  33.52 
 
 
733 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  33.52 
 
 
733 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  33.52 
 
 
733 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.15 
 
 
497 aa  324  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  33.57 
 
 
733 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  32.06 
 
 
691 aa  320  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.1 
 
 
733 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  33.24 
 
 
733 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  33.29 
 
 
733 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.91 
 
 
756 aa  317  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  33.23 
 
 
748 aa  313  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  30.93 
 
 
737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  32.66 
 
 
748 aa  308  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  31.46 
 
 
685 aa  307  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.41 
 
 
693 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
724 aa  300  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  30.57 
 
 
829 aa  297  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.01 
 
 
1321 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  33.38 
 
 
779 aa  293  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  34.16 
 
 
748 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  34.16 
 
 
751 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.68 
 
 
1338 aa  290  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  34 
 
 
751 aa  290  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  34 
 
 
751 aa  290  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  32.19 
 
 
730 aa  290  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
805 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.57 
 
 
772 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  31.99 
 
 
731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.75 
 
 
1158 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  38.44 
 
 
851 aa  280  7e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.15 
 
 
712 aa  279  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  33.28 
 
 
808 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.91 
 
 
772 aa  273  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  40.61 
 
 
843 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  41.42 
 
 
823 aa  272  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  31.63 
 
 
735 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.08 
 
 
778 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.08 
 
 
778 aa  267  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.05 
 
 
820 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.35 
 
 
765 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.35 
 
 
765 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.2 
 
 
765 aa  264  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.2 
 
 
765 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.2 
 
 
765 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.2 
 
 
765 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.2 
 
 
765 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.2 
 
 
765 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 
762 aa  263  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.81 
 
 
772 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.02 
 
 
814 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>