More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0871 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.77 
 
 		 771 aa  826    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 778 aa  1578    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  54.42 
 
 		 790 aa  846    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.62 
 
 		 756 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.82 
 
 		 760 aa  683    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  58.52 
 
 		 777 aa  929    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  79.74 
 
 		 772 aa  1252    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  46.68 
 
 		 805 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.31 
 
 		 795 aa  704    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.67 
 
 		 755 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.64 
 
 		 782 aa  796    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.01 
 
 		 762 aa  828    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  98.71 
 
 		 778 aa  1564    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.06 
 
 		 773 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  42.59 
 
 		 817 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.95 
 
 		 783 aa  625  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  41.34 
 
 		 788 aa  615  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.42 
 
 		 785 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.59 
 
 		 769 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.8 
 
 		 760 aa  598  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.99 
 
 		 792 aa  596  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.77 
 
 		 798 aa  592  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  42.07 
 
 		 802 aa  591  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.88 
 
 		 771 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.52 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.2 
 
 		 806 aa  588  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.65 
 
 		 807 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.31 
 
 		 791 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.97 
 
 		 760 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  41.58 
 
 		 808 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  41.46 
 
 		 811 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.55 
 
 		 778 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.35 
 
 		 807 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.68 
 
 		 809 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.98 
 
 		 790 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.56 
 
 		 768 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.08 
 
 		 803 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  39.34 
 
 		 789 aa  535  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  40.13 
 
 		 1037 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.38 
 
 		 811 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.25 
 
 		 813 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  39.08 
 
 		 859 aa  502  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.11 
 
 		 799 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  36.79 
 
 		 743 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  39.11 
 
 		 738 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.17 
 
 		 902 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.39 
 
 		 757 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  36.58 
 
 		 740 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.3 
 
 		 754 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  37.68 
 
 		 750 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.02 
 
 		 801 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  35.75 
 
 		 743 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.99 
 
 		 760 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.9 
 
 		 793 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.77 
 
 		 766 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.28 
 
 		 751 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.7 
 
 		 721 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.04 
 
 		 752 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.41 
 
 		 769 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  37.06 
 
 		 727 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  36.93 
 
 		 727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  37.15 
 
 		 772 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 		 751 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  37.84 
 
 		 737 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  37.56 
 
 		 765 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.44 
 
 		 769 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  35.84 
 
 		 766 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.79 
 
 		 804 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 		 763 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  35.79 
 
 		 768 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  35.62 
 
 		 763 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 		 753 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 751 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.51 
 
 		 762 aa  434  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  35.42 
 
 		 759 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.81 
 
 		 759 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.42 
 
 		 768 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  34.94 
 
 		 765 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 764 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 768 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.9 
 
 		 763 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  34.63 
 
 		 743 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.76 
 
 		 739 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  36.82 
 
 		 759 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.95 
 
 		 765 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.83 
 
 		 755 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.22 
 
 		 774 aa  426  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  36.74 
 
 		 787 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.95 
 
 		 755 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.65 
 
 		 763 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.37 
 
 		 765 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.95 
 
 		 755 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.95 
 
 		 755 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  34.69 
 
 		 763 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.16 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  34.16 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  34.16 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  34.03 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.33 
 
 		 733 aa  416  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 		 733 aa  415  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>