More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0187 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  64.15 
 
 
785 aa  1003    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.33 
 
 
778 aa  858    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
803 aa  1617    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  67 
 
 
809 aa  1020    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.96 
 
 
807 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.83 
 
 
790 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  52.64 
 
 
773 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.49 
 
 
760 aa  865    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  53.15 
 
 
791 aa  715    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  50.2 
 
 
817 aa  707    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.05 
 
 
813 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.87 
 
 
806 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  58.72 
 
 
760 aa  880    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.52 
 
 
771 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.99 
 
 
768 aa  785    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  52.01 
 
 
769 aa  678    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.59 
 
 
798 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.29 
 
 
811 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  43.08 
 
 
778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  43.08 
 
 
778 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  40.61 
 
 
777 aa  565  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.31 
 
 
762 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  41.22 
 
 
790 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  42.69 
 
 
788 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.75 
 
 
771 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  40.92 
 
 
772 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  43.43 
 
 
802 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.12 
 
 
760 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.17 
 
 
795 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.66 
 
 
755 aa  482  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.61 
 
 
782 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  38.49 
 
 
805 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.34 
 
 
783 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.08 
 
 
760 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  34.68 
 
 
743 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.75 
 
 
902 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.38 
 
 
756 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.45 
 
 
808 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.17 
 
 
721 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  37.72 
 
 
811 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.56 
 
 
792 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.42 
 
 
784 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 
807 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
754 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34 
 
 
757 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 
772 aa  379  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.62 
 
 
793 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  36.19 
 
 
738 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
799 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.2 
 
 
752 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.24 
 
 
804 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  35.93 
 
 
789 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  37.47 
 
 
1037 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.9 
 
 
743 aa  364  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  32.05 
 
 
766 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  34.25 
 
 
787 aa  363  6e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 
766 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  31.02 
 
 
740 aa  360  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 
751 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.01 
 
 
751 aa  359  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.19 
 
 
750 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  34.39 
 
 
723 aa  354  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.51 
 
 
859 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.55 
 
 
774 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.52 
 
 
772 aa  352  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.77 
 
 
801 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.99 
 
 
765 aa  351  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  34.56 
 
 
759 aa  351  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.52 
 
 
763 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.68 
 
 
712 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 
763 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.43 
 
 
755 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.47 
 
 
723 aa  347  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 
727 aa  347  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.43 
 
 
765 aa  347  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  33.6 
 
 
727 aa  347  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.3 
 
 
755 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.38 
 
 
763 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.56 
 
 
765 aa  345  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.3 
 
 
755 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 
733 aa  345  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.56 
 
 
765 aa  345  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.18 
 
 
755 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  34.23 
 
 
763 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.71 
 
 
763 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.43 
 
 
765 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.43 
 
 
765 aa  343  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.43 
 
 
765 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.43 
 
 
765 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  35.74 
 
 
737 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.52 
 
 
769 aa  343  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.92 
 
 
738 aa  343  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.83 
 
 
733 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.3 
 
 
765 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.22 
 
 
769 aa  342  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.12 
 
 
749 aa  342  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 
765 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.17 
 
 
765 aa  340  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  34.89 
 
 
763 aa  339  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  32.39 
 
 
739 aa  339  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>