More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.13 
 
 		 790 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.14 
 
 		 760 aa  959    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.58 
 
 		 760 aa  990    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 785 aa  1549    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.88 
 
 		 809 aa  986    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.84 
 
 		 807 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  55.5 
 
 		 773 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  54.7 
 
 		 817 aa  761    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  67.2 
 
 		 768 aa  914    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.15 
 
 		 803 aa  965    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  55.06 
 
 		 791 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.14 
 
 		 771 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.63 
 
 		 811 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  52.58 
 
 		 769 aa  673    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.84 
 
 		 813 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.98 
 
 		 778 aa  907    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.05 
 
 		 806 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.47 
 
 		 798 aa  631  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  44.42 
 
 		 778 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  44.53 
 
 		 778 aa  596  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  40.62 
 
 		 777 aa  571  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.05 
 
 		 762 aa  555  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  43.6 
 
 		 790 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  42.35 
 
 		 772 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.95 
 
 		 771 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.1 
 
 		 782 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  39.26 
 
 		 788 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  42.19 
 
 		 802 aa  498  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.65 
 
 		 795 aa  489  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.92 
 
 		 760 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.06 
 
 		 755 aa  484  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 		 805 aa  479  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.62 
 
 		 760 aa  479  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.31 
 
 		 783 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.13 
 
 		 902 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  38.55 
 
 		 1037 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  38.75 
 
 		 811 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.63 
 
 		 756 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.45 
 
 		 754 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.21 
 
 		 757 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.9 
 
 		 792 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.09 
 
 		 784 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 772 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  37 
 
 		 789 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.61 
 
 		 721 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.31 
 
 		 808 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.58 
 
 		 743 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.15 
 
 		 807 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  37.66 
 
 		 859 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 793 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  34.37 
 
 		 743 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  36.4 
 
 		 738 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  37.97 
 
 		 737 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  31.03 
 
 		 740 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 		 801 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.38 
 
 		 804 aa  357  6.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.7 
 
 		 750 aa  356  8.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  31.92 
 
 		 766 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.76 
 
 		 765 aa  354  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.48 
 
 		 751 aa  353  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.94 
 
 		 751 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.56 
 
 		 739 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  35.28 
 
 		 763 aa  349  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  32.92 
 
 		 787 aa  348  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  36.5 
 
 		 764 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.3 
 
 		 714 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.58 
 
 		 759 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  34.99 
 
 		 759 aa  344  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 		 752 aa  343  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 		 749 aa  342  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.55 
 
 		 799 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.54 
 
 		 723 aa  342  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.01 
 
 		 765 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.94 
 
 		 759 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.6 
 
 		 733 aa  336  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.78 
 
 		 766 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  30.69 
 
 		 743 aa  335  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.54 
 
 		 702 aa  334  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 		 751 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 		 733 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.14 
 
 		 742 aa  333  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.65 
 
 		 772 aa  333  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.39 
 
 		 765 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.51 
 
 		 774 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.39 
 
 		 765 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.26 
 
 		 765 aa  326  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.26 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 		 780 aa  326  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.26 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.26 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  32.04 
 
 		 759 aa  326  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  33.25 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 		 727 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 763 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35 
 
 		 724 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.26 
 
 		 765 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  34.99 
 
 		 764 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  33.43 
 
 		 763 aa  324  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.13 
 
 		 765 aa  323  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  33.28 
 
 		 763 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>