More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0078 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  45.8 
 
 
743 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.48 
 
 
754 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  49.38 
 
 
721 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
702 aa  1420    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  47.66 
 
 
738 aa  628  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  47.68 
 
 
727 aa  621  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  47.68 
 
 
727 aa  621  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  47.5 
 
 
750 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  43.81 
 
 
740 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  46.43 
 
 
772 aa  615  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  43.07 
 
 
766 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  45.11 
 
 
751 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.26 
 
 
723 aa  591  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.62 
 
 
751 aa  585  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.48 
 
 
804 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.95 
 
 
766 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  42 
 
 
743 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.72 
 
 
752 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.5 
 
 
751 aa  562  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  41.3 
 
 
745 aa  559  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  44.62 
 
 
759 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 
763 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  39.65 
 
 
743 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  43.07 
 
 
723 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  39.89 
 
 
765 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  43.97 
 
 
739 aa  535  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  40.03 
 
 
753 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.48 
 
 
759 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  43.84 
 
 
740 aa  532  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  39.43 
 
 
763 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  39.43 
 
 
763 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  42.95 
 
 
763 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  39.92 
 
 
765 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  39.57 
 
 
763 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.3 
 
 
733 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  39.95 
 
 
759 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  38.95 
 
 
765 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  38.92 
 
 
755 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  38.36 
 
 
765 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.73 
 
 
765 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  38.73 
 
 
765 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  38.6 
 
 
765 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  38.95 
 
 
755 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  38.92 
 
 
755 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  38.78 
 
 
755 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  39.16 
 
 
763 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.22 
 
 
769 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  38.6 
 
 
765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  38.6 
 
 
765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  38.6 
 
 
765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  38.6 
 
 
765 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  38.6 
 
 
765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.69 
 
 
769 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  38.6 
 
 
765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.42 
 
 
724 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  40.51 
 
 
764 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  39.57 
 
 
774 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  37.58 
 
 
772 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.29 
 
 
742 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.84 
 
 
733 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  39.84 
 
 
764 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.02 
 
 
768 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  40.81 
 
 
768 aa  505  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.1 
 
 
714 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.72 
 
 
768 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  42.49 
 
 
764 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  44.59 
 
 
743 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.86 
 
 
743 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.07 
 
 
760 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3299  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 
716 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.97 
 
 
713 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  36.38 
 
 
777 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3526  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.45 
 
 
727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.045935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  38.34 
 
 
790 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
771 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  37.12 
 
 
750 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  34.57 
 
 
778 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.07 
 
 
762 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.15 
 
 
739 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  34.7 
 
 
778 aa  426  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  36.83 
 
 
805 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.28 
 
 
756 aa  422  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 
808 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.87 
 
 
782 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.42 
 
 
736 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  36.45 
 
 
758 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 
807 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.3 
 
 
765 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.56 
 
 
772 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.26 
 
 
795 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.16 
 
 
783 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
762 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  34.5 
 
 
787 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.72 
 
 
749 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 
820 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  33.51 
 
 
759 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  35.81 
 
 
755 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
792 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.53 
 
 
760 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.08 
 
 
755 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>