More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3577 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  47.56 
 
 		 759 aa  731    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  47.88 
 
 		 758 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  46.89 
 
 		 820 aa  710    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  100 
 
 		 750 aa  1547    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  46.34 
 
 		 755 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  40.47 
 
 		 739 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.4 
 
 		 736 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  37.43 
 
 		 772 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.5 
 
 		 738 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.12 
 
 		 702 aa  416  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  34.36 
 
 		 766 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 		 721 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.73 
 
 		 762 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 		 828 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.11 
 
 		 752 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.18 
 
 		 762 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.54 
 
 		 743 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26742  beta-glucosidase  33.65 
 
 		 953 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  33.16 
 
 		 763 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.74 
 
 		 756 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 763 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 751 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.19 
 
 		 766 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  33.16 
 
 		 763 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.47 
 
 		 737 aa  392  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 753 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.76 
 
 		 763 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  33.77 
 
 		 772 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.89 
 
 		 763 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 		 765 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.33 
 
 		 765 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.04 
 
 		 769 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  33.47 
 
 		 750 aa  389  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 		 778 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.38 
 
 		 804 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.59 
 
 		 769 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.67 
 
 		 745 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.42 
 
 		 754 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.51 
 
 		 778 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.66 
 
 		 774 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  33.68 
 
 		 764 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.88 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 		 751 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  33.07 
 
 		 765 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.93 
 
 		 755 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.89 
 
 		 755 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.75 
 
 		 755 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 		 771 aa  376  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.62 
 
 		 755 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.75 
 
 		 743 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 		 860 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.88 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 		 765 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  32.2 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.75 
 
 		 765 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.88 
 
 		 765 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  33.42 
 
 		 764 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.88 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.88 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.48 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  35.66 
 
 		 790 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.84 
 
 		 751 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.62 
 
 		 765 aa  364  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  31.75 
 
 		 765 aa  364  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.86 
 
 		 765 aa  363  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.7 
 
 		 782 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  32.28 
 
 		 727 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  30.95 
 
 		 768 aa  360  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  32.15 
 
 		 727 aa  360  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.05 
 
 		 777 aa  354  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.69 
 
 		 792 aa  354  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.02 
 
 		 799 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.73 
 
 		 615 aa  348  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.42 
 
 		 784 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.73 
 
 		 807 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 		 743 aa  343  7e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  33.88 
 
 		 723 aa  341  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 		 749 aa  340  8e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  32.42 
 
 		 763 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.12 
 
 		 808 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 		 759 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.64 
 
 		 787 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  35.41 
 
 		 618 aa  336  7.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.21 
 
 		 765 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.02 
 
 		 733 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.73 
 
 		 795 aa  334  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.98 
 
 		 773 aa  333  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.51 
 
 		 783 aa  332  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 		 723 aa  331  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.36 
 
 		 760 aa  331  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.64 
 
 		 713 aa  328  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 		 759 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  30.88 
 
 		 788 aa  327  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.21 
 
 		 755 aa  325  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 		 760 aa  324  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  32.88 
 
 		 740 aa  323  8e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  32.88 
 
 		 739 aa  323  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.89 
 
 		 801 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.5 
 
 		 724 aa  321  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>