More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3577 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
723 aa  1398    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.26 
 
 
702 aa  585  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  42.55 
 
 
727 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  42.55 
 
 
727 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  43.54 
 
 
721 aa  532  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.2 
 
 
754 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.92 
 
 
733 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  44.52 
 
 
738 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.15 
 
 
751 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  39.66 
 
 
743 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.3 
 
 
766 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 
772 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  37.12 
 
 
743 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  38.39 
 
 
765 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.95 
 
 
804 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  37.01 
 
 
740 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 
766 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.37 
 
 
714 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 
751 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  42.45 
 
 
750 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  37.31 
 
 
743 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.56 
 
 
769 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  39.06 
 
 
774 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.87 
 
 
768 aa  475  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  42.7 
 
 
723 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  36.94 
 
 
759 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.13 
 
 
751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.06 
 
 
769 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.38 
 
 
752 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.01 
 
 
768 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  40.99 
 
 
768 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  38.65 
 
 
763 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  37.53 
 
 
753 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  37.74 
 
 
755 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 
763 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.13 
 
 
742 aa  459  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  35.33 
 
 
745 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  41.74 
 
 
759 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  38.04 
 
 
755 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  38.78 
 
 
763 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  38.04 
 
 
765 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.19 
 
 
765 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  37.42 
 
 
765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  37.19 
 
 
765 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  40.67 
 
 
739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  37.6 
 
 
755 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  38.65 
 
 
763 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  37.74 
 
 
755 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  38.51 
 
 
763 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  37.19 
 
 
765 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  37.05 
 
 
765 aa  452  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  37.24 
 
 
765 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  37.05 
 
 
765 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  38.7 
 
 
765 aa  452  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  37.05 
 
 
765 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  37.73 
 
 
772 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  37.05 
 
 
765 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.16 
 
 
733 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  37.05 
 
 
765 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  40.4 
 
 
740 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  39.76 
 
 
764 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  44.04 
 
 
743 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  39.05 
 
 
764 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.21 
 
 
743 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.18 
 
 
759 aa  439  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  41.63 
 
 
763 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3299  glycoside hydrolase family protein  42.6 
 
 
716 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.82 
 
 
724 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3526  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.95 
 
 
727 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.045935 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.97 
 
 
760 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.72 
 
 
713 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  39.01 
 
 
764 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.9 
 
 
765 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  34.08 
 
 
778 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.73 
 
 
778 aa  385  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.57 
 
 
777 aa  382  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.24 
 
 
795 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.55 
 
 
782 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  33.78 
 
 
772 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 
805 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 
762 aa  369  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.75 
 
 
790 aa  366  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  34.35 
 
 
787 aa  364  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  36.23 
 
 
817 aa  363  6e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
749 aa  361  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.79 
 
 
762 aa  359  8e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 
771 aa  353  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  37.34 
 
 
737 aa  352  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.95 
 
 
773 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.3 
 
 
736 aa  346  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.54 
 
 
785 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.62 
 
 
758 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  32.88 
 
 
739 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  31.24 
 
 
755 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.67 
 
 
750 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.68 
 
 
780 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.82 
 
 
808 aa  331  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.51 
 
 
791 aa  331  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.97 
 
 
769 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>