More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0852 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  53.17 
 
 
772 aa  784    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  51.1 
 
 
790 aa  771    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
762 aa  1545    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.8 
 
 
771 aa  788    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.59 
 
 
756 aa  644    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.64 
 
 
795 aa  682    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 
805 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  55.46 
 
 
777 aa  858    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.86 
 
 
760 aa  656    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.78 
 
 
782 aa  735    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.99 
 
 
755 aa  682    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.76 
 
 
783 aa  659    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  55.01 
 
 
778 aa  827    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  55.01 
 
 
778 aa  828    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.93 
 
 
807 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.17 
 
 
760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.26 
 
 
773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  41.25 
 
 
817 aa  601  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.12 
 
 
771 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.46 
 
 
806 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  42.15 
 
 
802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.79 
 
 
792 aa  562  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  40.92 
 
 
788 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.79 
 
 
798 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.71 
 
 
784 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.01 
 
 
791 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.05 
 
 
785 aa  555  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.94 
 
 
807 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 
760 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.13 
 
 
778 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  41.42 
 
 
808 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.15 
 
 
809 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.72 
 
 
790 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  39.47 
 
 
811 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  38.55 
 
 
743 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.73 
 
 
769 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.84 
 
 
768 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.31 
 
 
803 aa  515  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.28 
 
 
799 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  39.41 
 
 
772 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  37.81 
 
 
859 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  39.35 
 
 
1037 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  37.01 
 
 
789 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.69 
 
 
813 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.7 
 
 
811 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.88 
 
 
754 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 
902 aa  499  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.92 
 
 
766 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.88 
 
 
757 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  38.68 
 
 
765 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  39.07 
 
 
753 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  37.92 
 
 
768 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  37.5 
 
 
765 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 
763 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  37.63 
 
 
755 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  37.76 
 
 
765 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  38.03 
 
 
763 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  37.76 
 
 
765 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  37.37 
 
 
755 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  37.76 
 
 
765 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  38.14 
 
 
763 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  37.76 
 
 
765 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  37.76 
 
 
765 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  37.37 
 
 
755 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  37.5 
 
 
755 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 
765 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  37.63 
 
 
765 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 
769 aa  475  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  38.47 
 
 
774 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  37.63 
 
 
765 aa  476  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  37.63 
 
 
765 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.16 
 
 
769 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  39.92 
 
 
739 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 
766 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  37.9 
 
 
763 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  38.03 
 
 
763 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.4 
 
 
760 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.04 
 
 
751 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.95 
 
 
804 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  37.53 
 
 
738 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  37.07 
 
 
721 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 
768 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.65 
 
 
751 aa  465  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.79 
 
 
768 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  36.12 
 
 
772 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.68 
 
 
801 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.45 
 
 
752 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  37.04 
 
 
765 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  36.84 
 
 
764 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  35.58 
 
 
743 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 
765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  36.38 
 
 
764 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  34.75 
 
 
740 aa  445  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  39.19 
 
 
759 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.42 
 
 
762 aa  435  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.47 
 
 
712 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  37.12 
 
 
905 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.17 
 
 
738 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  36.23 
 
 
750 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  34.97 
 
 
759 aa  429  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>