More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2862 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 757 aa  1571    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  35.98 
 
 		 777 aa  494  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.12 
 
 		 805 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.88 
 
 		 762 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.77 
 
 		 807 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  36.55 
 
 		 778 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  36.39 
 
 		 778 aa  485  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.42 
 
 		 760 aa  479  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  37.19 
 
 		 759 aa  472  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.72 
 
 		 790 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  35.13 
 
 		 772 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.99 
 
 		 771 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.36 
 
 		 859 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 792 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.67 
 
 		 756 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  36.2 
 
 		 772 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.19 
 
 		 799 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 		 782 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.05 
 
 		 784 aa  429  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.53 
 
 		 754 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.25 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 		 755 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  33.67 
 
 		 788 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 795 aa  422  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.08 
 
 		 760 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.86 
 
 		 743 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  33.59 
 
 		 808 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.21 
 
 		 785 aa  416  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.95 
 
 		 751 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.54 
 
 		 762 aa  412  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.69 
 
 		 743 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.2 
 
 		 766 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.14 
 
 		 902 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  32.96 
 
 		 802 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.14 
 
 		 752 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.36 
 
 		 774 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.82 
 
 		 766 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 		 778 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.73 
 
 		 809 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  33.93 
 
 		 738 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.38 
 
 		 768 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 1037 aa  386  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  34.3 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  33.7 
 
 		 721 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 		 749 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.32 
 
 		 750 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  31.18 
 
 		 817 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  34.14 
 
 		 768 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.99 
 
 		 806 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.99 
 
 		 804 aa  379  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  34.12 
 
 		 787 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 		 760 aa  379  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  32.77 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 		 789 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.79 
 
 		 768 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.06 
 
 		 768 aa  376  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32 
 
 		 798 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.62 
 
 		 765 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 		 702 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.38 
 
 		 737 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  30.08 
 
 		 740 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  33.92 
 
 		 723 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 763 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.08 
 
 		 755 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.08 
 
 		 755 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.08 
 
 		 755 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.09 
 
 		 755 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.43 
 
 		 733 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.25 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  32.88 
 
 		 759 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.06 
 
 		 773 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  32.19 
 
 		 811 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.75 
 
 		 763 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  32.58 
 
 		 763 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.89 
 
 		 763 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.75 
 
 		 763 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 		 736 aa  364  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  31.6 
 
 		 765 aa  363  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 		 769 aa  363  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.79 
 
 		 758 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.39 
 
 		 745 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.3 
 
 		 751 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  30.78 
 
 		 764 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.82 
 
 		 769 aa  362  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  30.69 
 
 		 764 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 753 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.08 
 
 		 759 aa  359  9e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.4 
 
 		 772 aa  359  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  31.9 
 
 		 765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.42 
 
 		 769 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.43 
 
 		 759 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  30.85 
 
 		 765 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  30.85 
 
 		 765 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  30.85 
 
 		 765 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 		 765 aa  355  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  30.85 
 
 		 765 aa  355  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  30.85 
 
 		 765 aa  355  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>