More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3480 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  61.38 
 
 
809 aa  837    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.95 
 
 
813 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  64.98 
 
 
785 aa  924    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  55.31 
 
 
791 aa  748    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  58.22 
 
 
773 aa  805    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  54.74 
 
 
769 aa  723    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.49 
 
 
760 aa  884    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  51.51 
 
 
798 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  65.32 
 
 
768 aa  875    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.91 
 
 
806 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  57.25 
 
 
817 aa  824    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.65 
 
 
771 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.4 
 
 
760 aa  886    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  58.37 
 
 
807 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.33 
 
 
803 aa  839    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.77 
 
 
790 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.83 
 
 
811 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
778 aa  1536    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  41.68 
 
 
778 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  41.68 
 
 
778 aa  572  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.13 
 
 
762 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  43.05 
 
 
790 aa  561  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  38.06 
 
 
777 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  41.39 
 
 
772 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 
771 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  38.88 
 
 
788 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  43.97 
 
 
802 aa  515  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.67 
 
 
760 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.75 
 
 
782 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.13 
 
 
783 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.01 
 
 
795 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.18 
 
 
755 aa  475  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 
805 aa  476  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.64 
 
 
760 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.58 
 
 
902 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 
756 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  38.54 
 
 
811 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  36.64 
 
 
808 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.51 
 
 
754 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  38.13 
 
 
859 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.47 
 
 
743 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 
757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.45 
 
 
792 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.91 
 
 
784 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  37.17 
 
 
789 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.08 
 
 
807 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.54 
 
 
721 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  37.67 
 
 
737 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  37.68 
 
 
793 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 
772 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  34.72 
 
 
759 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.7 
 
 
801 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 
1037 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  33.5 
 
 
743 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  32.74 
 
 
766 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.7 
 
 
766 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.86 
 
 
765 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.73 
 
 
765 aa  360  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.73 
 
 
765 aa  360  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.63 
 
 
804 aa  359  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.6 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  35.98 
 
 
723 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.6 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.6 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.02 
 
 
750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.6 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.6 
 
 
765 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.73 
 
 
755 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.74 
 
 
765 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.47 
 
 
765 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.61 
 
 
755 aa  357  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.48 
 
 
755 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.61 
 
 
755 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.47 
 
 
765 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  33.51 
 
 
765 aa  354  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.74 
 
 
799 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  34.49 
 
 
768 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.65 
 
 
765 aa  353  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.17 
 
 
762 aa  352  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 
733 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.86 
 
 
772 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33 
 
 
774 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  32.89 
 
 
739 aa  351  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.03 
 
 
751 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  35.57 
 
 
763 aa  351  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  34.98 
 
 
738 aa  350  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.86 
 
 
752 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.53 
 
 
759 aa  348  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 
738 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.15 
 
 
724 aa  346  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.11 
 
 
751 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.09 
 
 
733 aa  343  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  36.32 
 
 
764 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.84 
 
 
702 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  29.59 
 
 
740 aa  341  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 
769 aa  340  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.64 
 
 
759 aa  340  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 
764 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.26 
 
 
787 aa  339  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  34.86 
 
 
739 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>