More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3818 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.17 
 
 
811 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.66 
 
 
760 aa  722    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.64 
 
 
760 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  57.31 
 
 
773 aa  800    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.76 
 
 
809 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  55.08 
 
 
769 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  68.12 
 
 
791 aa  1021    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  54 
 
 
785 aa  718    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.46 
 
 
768 aa  674    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.83 
 
 
803 aa  645    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  50.39 
 
 
798 aa  673    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
790 aa  1552    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  61.5 
 
 
806 aa  848    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  67.41 
 
 
807 aa  973    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  58.55 
 
 
817 aa  896    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.83 
 
 
771 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.77 
 
 
778 aa  731    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.44 
 
 
813 aa  907    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  41.98 
 
 
778 aa  592  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  41.93 
 
 
778 aa  593  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.72 
 
 
762 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  39.38 
 
 
777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  43.68 
 
 
790 aa  568  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  40.77 
 
 
772 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  39.4 
 
 
788 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  42.38 
 
 
802 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.44 
 
 
760 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.63 
 
 
771 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.16 
 
 
783 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.64 
 
 
782 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.13 
 
 
755 aa  482  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.2 
 
 
795 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  39.61 
 
 
789 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  39.12 
 
 
811 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  37.61 
 
 
805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.55 
 
 
756 aa  439  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  37.24 
 
 
808 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.42 
 
 
760 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.35 
 
 
792 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 
784 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.69 
 
 
754 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.52 
 
 
902 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.04 
 
 
807 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.42 
 
 
743 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  34.64 
 
 
765 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  37.16 
 
 
1037 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.47 
 
 
804 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  36.21 
 
 
738 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.71 
 
 
757 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.89 
 
 
752 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.29 
 
 
742 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.41 
 
 
751 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  36.68 
 
 
723 aa  361  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  34.58 
 
 
793 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  34.05 
 
 
787 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.87 
 
 
733 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  35.36 
 
 
768 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 
769 aa  356  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.36 
 
 
859 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  35.83 
 
 
737 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 
766 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 
763 aa  353  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  36.18 
 
 
739 aa  351  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.3 
 
 
751 aa  351  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.31 
 
 
743 aa  350  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.89 
 
 
743 aa  349  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  36.05 
 
 
740 aa  349  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.32 
 
 
774 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32 
 
 
765 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32 
 
 
755 aa  347  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  35.22 
 
 
764 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.87 
 
 
755 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  31.87 
 
 
755 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 
763 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  31.74 
 
 
755 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.09 
 
 
765 aa  343  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.13 
 
 
739 aa  343  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  38.9 
 
 
743 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 
772 aa  342  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  31.11 
 
 
766 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  34.95 
 
 
764 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.25 
 
 
765 aa  340  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.25 
 
 
765 aa  340  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.46 
 
 
763 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.2 
 
 
765 aa  340  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.65 
 
 
772 aa  340  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.25 
 
 
765 aa  340  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  34.48 
 
 
727 aa  340  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.5 
 
 
759 aa  339  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.11 
 
 
765 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.11 
 
 
765 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.11 
 
 
765 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.11 
 
 
765 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  30.59 
 
 
743 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  34.54 
 
 
763 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  34.18 
 
 
727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.31 
 
 
763 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  34.22 
 
 
721 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 
769 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.11 
 
 
765 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>