More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2050 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.58 
 
 
809 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  52.46 
 
 
769 aa  722    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.5 
 
 
760 aa  770    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.2 
 
 
803 aa  665    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.96 
 
 
760 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.71 
 
 
768 aa  754    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.03 
 
 
771 aa  884    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.03 
 
 
813 aa  842    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  58.55 
 
 
790 aa  842    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.29 
 
 
811 aa  786    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  50.94 
 
 
798 aa  730    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  54.7 
 
 
785 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  55.54 
 
 
773 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
817 aa  1637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.9 
 
 
806 aa  908    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.02 
 
 
807 aa  866    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  60.69 
 
 
791 aa  906    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.25 
 
 
778 aa  803    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  42.59 
 
 
778 aa  623  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  42.44 
 
 
778 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.25 
 
 
762 aa  601  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  38.19 
 
 
777 aa  590  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  40.53 
 
 
772 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  41.26 
 
 
790 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  41.25 
 
 
802 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 
771 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  37.65 
 
 
788 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.73 
 
 
782 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
795 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.69 
 
 
760 aa  482  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.51 
 
 
783 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.82 
 
 
755 aa  457  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
805 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 
756 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 
760 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  37.07 
 
 
811 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.83 
 
 
902 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 
807 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.35 
 
 
792 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 
754 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.01 
 
 
784 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  36.35 
 
 
808 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  35.52 
 
 
789 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.68 
 
 
743 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.24 
 
 
859 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  36.39 
 
 
1037 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 
757 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.43 
 
 
793 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 
721 aa  366  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.27 
 
 
759 aa  366  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  32.96 
 
 
759 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.23 
 
 
723 aa  360  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 
804 aa  360  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 
733 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  31.75 
 
 
740 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.48 
 
 
750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.69 
 
 
751 aa  356  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  33.5 
 
 
787 aa  356  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  30.92 
 
 
743 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 
772 aa  351  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 
738 aa  350  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 
752 aa  349  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.57 
 
 
801 aa  347  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.27 
 
 
742 aa  347  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 
765 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.27 
 
 
765 aa  344  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.03 
 
 
736 aa  343  5e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.11 
 
 
743 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 
749 aa  343  8e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.08 
 
 
768 aa  343  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  35.36 
 
 
737 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.69 
 
 
745 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.61 
 
 
766 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  34.16 
 
 
763 aa  337  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.5 
 
 
799 aa  336  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.53 
 
 
743 aa  334  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  31.22 
 
 
739 aa  331  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.3 
 
 
738 aa  330  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 
727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  32.44 
 
 
727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  37.13 
 
 
743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 
751 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.37 
 
 
774 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  32.22 
 
 
759 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 
702 aa  326  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  35.28 
 
 
764 aa  323  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 
751 aa  323  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  32.5 
 
 
723 aa  323  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 
769 aa  323  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.66 
 
 
766 aa  323  9.000000000000001e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 
780 aa  321  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.09 
 
 
765 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
724 aa  320  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3299  glycoside hydrolase family protein  35.35 
 
 
716 aa  320  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.71 
 
 
765 aa  320  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  31.35 
 
 
755 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.22 
 
 
755 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.58 
 
 
769 aa  318  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  29.03 
 
 
760 aa  318  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  31.22 
 
 
755 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>