More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2539 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 760 aa  1508    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  70.93 
 
 		 902 aa  1014    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  43.8 
 
 		 790 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  36.85 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.9 
 
 		 785 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.4 
 
 		 760 aa  485  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  43.59 
 
 		 773 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.68 
 
 		 762 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.62 
 
 		 782 aa  482  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  37.99 
 
 		 778 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 		 778 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 		 771 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 		 760 aa  465  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.24 
 
 		 795 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.73 
 
 		 760 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  40.81 
 
 		 802 aa  459  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.22 
 
 		 768 aa  458  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  38.22 
 
 		 772 aa  459  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  38.05 
 
 		 805 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  40.16 
 
 		 817 aa  452  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.13 
 
 		 778 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 		 807 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.64 
 
 		 756 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.62 
 
 		 769 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.7 
 
 		 755 aa  432  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.51 
 
 		 798 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.95 
 
 		 783 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  38.46 
 
 		 811 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.37 
 
 		 803 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.8 
 
 		 809 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.26 
 
 		 791 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.48 
 
 		 790 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.93 
 
 		 806 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.78 
 
 		 771 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  34.33 
 
 		 788 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.56 
 
 		 792 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 		 757 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  38.24 
 
 		 737 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.62 
 
 		 743 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.58 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.64 
 
 		 807 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.11 
 
 		 754 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  38.01 
 
 		 789 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.71 
 
 		 808 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  36.64 
 
 		 859 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.51 
 
 		 813 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.19 
 
 		 751 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.84 
 
 		 799 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.52 
 
 		 811 aa  357  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.08 
 
 		 766 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  34.17 
 
 		 727 aa  353  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  34.12 
 
 		 727 aa  351  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  33.19 
 
 		 772 aa  350  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.02 
 
 		 762 aa  350  5e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 764 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  34.18 
 
 		 721 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.91 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  36.95 
 
 		 1037 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.89 
 
 		 751 aa  340  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  33.02 
 
 		 765 aa  337  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  35.57 
 
 		 759 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  30 
 
 		 740 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 		 766 aa  333  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.53 
 
 		 733 aa  333  8e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 		 769 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  30.68 
 
 		 743 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.38 
 
 		 750 aa  328  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.05 
 
 		 738 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.87 
 
 		 801 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.49 
 
 		 765 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  32.82 
 
 		 759 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.95 
 
 		 768 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.3 
 
 		 755 aa  323  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  34 
 
 		 763 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.69 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.69 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.16 
 
 		 765 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.16 
 
 		 755 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.69 
 
 		 765 aa  321  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 		 765 aa  320  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  30.73 
 
 		 765 aa  320  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.55 
 
 		 765 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.02 
 
 		 755 aa  320  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.02 
 
 		 755 aa  320  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.98 
 
 		 765 aa  318  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.41 
 
 		 765 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.61 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 712 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  31.55 
 
 		 765 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 		 702 aa  317  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  31.61 
 
 		 763 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.76 
 
 		 769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  32.91 
 
 		 738 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 		 745 aa  313  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  31.32 
 
 		 763 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  31.38 
 
 		 763 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.63 
 
 		 774 aa  312  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 751 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  31.32 
 
 		 763 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>