More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04180 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.8 
 
 
615 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.07 
 
 
644 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
618 aa  1262    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  52.51 
 
 
1271 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  52.17 
 
 
1271 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  49.2 
 
 
678 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  52.17 
 
 
612 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.92 
 
 
619 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  47.13 
 
 
599 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  46.62 
 
 
866 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.04 
 
 
900 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  46.35 
 
 
608 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.91 
 
 
844 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  47.83 
 
 
850 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  45.25 
 
 
880 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  45.27 
 
 
826 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  47.24 
 
 
850 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  46.79 
 
 
1072 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  46.01 
 
 
862 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 
866 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  42.66 
 
 
826 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  45.32 
 
 
856 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.17 
 
 
886 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  47.25 
 
 
886 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.33 
 
 
886 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  47.17 
 
 
886 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  45.48 
 
 
900 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.52 
 
 
639 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.38 
 
 
877 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  46.08 
 
 
862 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  43.48 
 
 
826 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  42.4 
 
 
811 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  41.99 
 
 
605 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.42 
 
 
736 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  38.88 
 
 
739 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  41.39 
 
 
859 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.55 
 
 
762 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  38.01 
 
 
737 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  34.76 
 
 
820 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  36.86 
 
 
755 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 
828 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  34.87 
 
 
758 aa  339  8e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  33.71 
 
 
759 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  35.41 
 
 
750 aa  336  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.63 
 
 
702 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  35.69 
 
 
743 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  34.98 
 
 
738 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  34.3 
 
 
743 aa  309  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.39 
 
 
754 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 
765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  33.9 
 
 
740 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.01 
 
 
752 aa  304  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  34.41 
 
 
745 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  33.67 
 
 
750 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.08 
 
 
804 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  34.84 
 
 
751 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  32.22 
 
 
721 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.01 
 
 
723 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.88 
 
 
765 aa  294  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 
766 aa  294  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.3 
 
 
733 aa  293  7e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.96 
 
 
727 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.96 
 
 
727 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  32.34 
 
 
787 aa  291  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 
751 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.09 
 
 
766 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 
772 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
805 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.82 
 
 
777 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.53 
 
 
756 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  33.33 
 
 
759 aa  283  7.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 
782 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.49 
 
 
749 aa  279  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.64 
 
 
772 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  33.08 
 
 
808 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.41 
 
 
771 aa  276  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 
753 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.65 
 
 
778 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.01 
 
 
760 aa  274  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 
762 aa  273  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.32 
 
 
714 aa  273  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33 
 
 
774 aa  273  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.78 
 
 
765 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 
768 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 
764 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  31.05 
 
 
763 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.45 
 
 
778 aa  270  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.46 
 
 
790 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 
751 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  32.45 
 
 
759 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.73 
 
 
807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  32.4 
 
 
739 aa  266  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 
724 aa  266  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.89 
 
 
763 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 
783 aa  266  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.89 
 
 
763 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.62 
 
 
763 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  32.4 
 
 
740 aa  265  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  32.21 
 
 
723 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.96 
 
 
772 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>