More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3263 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  100 
 
 
678 aa  1366    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  60.45 
 
 
1271 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  59.97 
 
 
1271 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  56.18 
 
 
612 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.64 
 
 
644 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  49.2 
 
 
618 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.45 
 
 
615 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.28 
 
 
619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  41.12 
 
 
1072 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.2 
 
 
877 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  43.41 
 
 
900 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 
866 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  38.36 
 
 
599 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.31 
 
 
900 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  41.4 
 
 
850 aa  405  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  39.38 
 
 
608 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  41.56 
 
 
826 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  40.92 
 
 
856 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.19 
 
 
886 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  40.19 
 
 
886 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  40.19 
 
 
886 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.19 
 
 
886 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  39.2 
 
 
866 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.41 
 
 
844 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  40.45 
 
 
826 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  39.34 
 
 
862 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  39.15 
 
 
850 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  40.06 
 
 
826 aa  379  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  37.79 
 
 
862 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  38.51 
 
 
880 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  39.64 
 
 
605 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.41 
 
 
639 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.69 
 
 
736 aa  362  9e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  36.93 
 
 
811 aa  356  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.42 
 
 
739 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  37.67 
 
 
859 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.28 
 
 
762 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  34.7 
 
 
737 aa  293  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  32.43 
 
 
758 aa  276  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.54 
 
 
828 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  31.92 
 
 
755 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.44 
 
 
820 aa  266  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.91 
 
 
750 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.62 
 
 
702 aa  252  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
805 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.94 
 
 
743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  29.16 
 
 
759 aa  243  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 
727 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.99 
 
 
727 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  32.28 
 
 
738 aa  236  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  30.05 
 
 
740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.29 
 
 
790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.57 
 
 
765 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.62 
 
 
754 aa  234  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.26 
 
 
778 aa  232  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.9 
 
 
765 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.79 
 
 
807 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.33 
 
 
749 aa  230  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  29.47 
 
 
787 aa  229  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 
778 aa  227  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 
751 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.16 
 
 
750 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.51 
 
 
771 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.59 
 
 
766 aa  220  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.86 
 
 
782 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.71 
 
 
751 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.3 
 
 
745 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.58 
 
 
804 aa  218  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  30.86 
 
 
774 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.89 
 
 
777 aa  217  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.95 
 
 
723 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  32.46 
 
 
721 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  33.38 
 
 
764 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.56 
 
 
780 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 
772 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.63 
 
 
772 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  32.01 
 
 
759 aa  206  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.86 
 
 
757 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.42 
 
 
766 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.01 
 
 
752 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 
743 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  31.41 
 
 
808 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.53 
 
 
762 aa  204  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.68 
 
 
768 aa  204  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.8 
 
 
784 aa  204  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.54 
 
 
860 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.43 
 
 
792 aa  201  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.33 
 
 
733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.02 
 
 
714 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  28.24 
 
 
759 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  27.86 
 
 
764 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  27.88 
 
 
764 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 
751 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.4 
 
 
806 aa  194  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  31.05 
 
 
886 aa  194  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  31.44 
 
 
739 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 
740 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  29.51 
 
 
765 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  31.34 
 
 
723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.94 
 
 
768 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>