More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2444 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.28 
 
 		 644 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  60.45 
 
 		 678 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 1271 aa  2573    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  87.16 
 
 		 1271 aa  2184    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  61.68 
 
 		 612 aa  721    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  52.51 
 
 		 618 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.79 
 
 		 615 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.68 
 
 		 619 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  43.19 
 
 		 900 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.23 
 
 		 900 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  43.3 
 
 		 850 aa  442  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  40.19 
 
 		 608 aa  439  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.14 
 
 		 877 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  38.81 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  41.42 
 
 		 1072 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  42.97 
 
 		 826 aa  426  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  41.85 
 
 		 856 aa  425  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  38.5 
 
 		 866 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  42.83 
 
 		 826 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  38.15 
 
 		 850 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  37.66 
 
 		 880 aa  416  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  42.65 
 
 		 826 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  41.96 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  41.42 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  40.27 
 
 		 862 aa  409  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  39.62 
 
 		 866 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.96 
 
 		 886 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  39.19 
 
 		 844 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.42 
 
 		 886 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  39.91 
 
 		 811 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  39.65 
 
 		 862 aa  406  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.75 
 
 		 736 aa  399  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  39.73 
 
 		 605 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.05 
 
 		 639 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.5 
 
 		 739 aa  348  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  36.93 
 
 		 859 aa  336  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 		 762 aa  306  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.17 
 
 		 758 aa  296  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  32.71 
 
 		 755 aa  296  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.79 
 
 		 828 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.58 
 
 		 820 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 		 702 aa  274  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.92 
 
 		 737 aa  272  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  29.19 
 
 		 759 aa  269  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.89 
 
 		 750 aa  263  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  30.73 
 
 		 743 aa  259  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.36 
 
 		 790 aa  258  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.3 
 
 		 795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  29.82 
 
 		 740 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.95 
 
 		 754 aa  255  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.35 
 
 		 774 aa  253  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.86 
 
 		 778 aa  251  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.56 
 
 		 766 aa  250  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 805 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.38 
 
 		 752 aa  245  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.12 
 
 		 723 aa  244  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.33 
 
 		 755 aa  244  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  29.33 
 
 		 755 aa  244  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.55 
 
 		 727 aa  244  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.33 
 
 		 755 aa  244  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  29.33 
 
 		 765 aa  244  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  29.33 
 
 		 755 aa  244  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 		 727 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.34 
 
 		 778 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.3 
 
 		 751 aa  241  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  31.22 
 
 		 750 aa  240  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.91 
 
 		 743 aa  240  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.63 
 
 		 787 aa  239  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 		 766 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 		 764 aa  239  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  29.94 
 
 		 738 aa  239  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.56 
 
 		 771 aa  238  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.73 
 
 		 749 aa  238  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.08 
 
 		 765 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 		 782 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.46 
 
 		 765 aa  236  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.24 
 
 		 765 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  30.94 
 
 		 808 aa  233  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.14 
 
 		 765 aa  233  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  28.69 
 
 		 772 aa  233  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.6 
 
 		 768 aa  233  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.1 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  29.39 
 
 		 765 aa  231  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.1 
 
 		 765 aa  231  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.1 
 
 		 765 aa  231  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  31.75 
 
 		 763 aa  231  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 772 aa  231  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.1 
 
 		 765 aa  231  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 		 753 aa  230  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  28.1 
 
 		 765 aa  231  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  28.1 
 
 		 765 aa  230  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  28.1 
 
 		 765 aa  231  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  31.07 
 
 		 764 aa  230  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  29.31 
 
 		 765 aa  230  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 751 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.62 
 
 		 745 aa  229  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.36 
 
 		 772 aa  228  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 		 807 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  31.4 
 
 		 759 aa  226  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  30.38 
 
 		 764 aa  225  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>