More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3725 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 605 aa  1254    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.21 
 
 		 615 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  41.99 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.21 
 
 		 619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 		 1271 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.07 
 
 		 644 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.85 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.72 
 
 		 900 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  39.73 
 
 		 1271 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.24 
 
 		 844 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  39.25 
 
 		 599 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  38.2 
 
 		 811 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  40.34 
 
 		 850 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  38.55 
 
 		 850 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  39.52 
 
 		 826 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  38.56 
 
 		 866 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  39.64 
 
 		 678 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  37.24 
 
 		 826 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  39.6 
 
 		 880 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  37.01 
 
 		 856 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  37.88 
 
 		 862 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  39.02 
 
 		 1072 aa  359  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  36.32 
 
 		 608 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  37.17 
 
 		 862 aa  356  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 		 900 aa  353  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  37.85 
 
 		 886 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  37.07 
 
 		 886 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.07 
 
 		 886 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  35.13 
 
 		 866 aa  343  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  37.77 
 
 		 826 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.05 
 
 		 886 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.21 
 
 		 877 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.06 
 
 		 736 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  38.46 
 
 		 859 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 639 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  36.02 
 
 		 758 aa  332  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  34.93 
 
 		 755 aa  322  9.000000000000001e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  33.55 
 
 		 759 aa  312  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.43 
 
 		 739 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  33.63 
 
 		 750 aa  299  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.03 
 
 		 762 aa  296  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.72 
 
 		 820 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.84 
 
 		 702 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  33.61 
 
 		 743 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  33.28 
 
 		 772 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 		 754 aa  274  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 		 804 aa  269  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.48 
 
 		 774 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.25 
 
 		 772 aa  268  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  31.79 
 
 		 740 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  33.68 
 
 		 721 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  33.8 
 
 		 738 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.32 
 
 		 766 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 		 765 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.03 
 
 		 765 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.03 
 
 		 765 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 		 765 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.03 
 
 		 765 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.03 
 
 		 765 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.03 
 
 		 765 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.33 
 
 		 752 aa  263  8.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 		 755 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 		 755 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 		 755 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 		 765 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  31.03 
 
 		 765 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.4 
 
 		 743 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  30.88 
 
 		 765 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  32.76 
 
 		 759 aa  260  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  30.63 
 
 		 766 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.26 
 
 		 828 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.83 
 
 		 727 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.71 
 
 		 727 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  31.31 
 
 		 737 aa  251  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.21 
 
 		 769 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.5 
 
 		 751 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 763 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 753 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.51 
 
 		 723 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  30.21 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 751 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.17 
 
 		 769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32 
 
 		 765 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.76 
 
 		 749 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  30.03 
 
 		 740 aa  243  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  30.41 
 
 		 765 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  30.71 
 
 		 768 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.07 
 
 		 750 aa  241  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.1 
 
 		 733 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  30.55 
 
 		 723 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  30.15 
 
 		 763 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.15 
 
 		 763 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.99 
 
 		 768 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  29.32 
 
 		 763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  30.31 
 
 		 763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.62 
 
 		 768 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  31.54 
 
 		 763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.29 
 
 		 765 aa  233  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  29.86 
 
 		 764 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>