More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6485 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  43.31 
 
 		 862 aa  653    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  56.52 
 
 		 866 aa  915    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  45.72 
 
 		 862 aa  692    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  45.13 
 
 		 866 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  46.21 
 
 		 886 aa  675    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  46.14 
 
 		 850 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  45.02 
 
 		 880 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  74.65 
 
 		 877 aa  1268    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 900 aa  1812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.11 
 
 		 900 aa  783    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.18 
 
 		 886 aa  680    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.21 
 
 		 886 aa  675    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  46.09 
 
 		 886 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  45.61 
 
 		 850 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  43.83 
 
 		 1072 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  44.82 
 
 		 826 aa  634  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  44.53 
 
 		 826 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  43.77 
 
 		 856 aa  613  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  42.49 
 
 		 844 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  43.07 
 
 		 826 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  40.92 
 
 		 811 aa  553  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  41.65 
 
 		 859 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  43.97 
 
 		 608 aa  505  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  45.48 
 
 		 618 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  40.68 
 
 		 599 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.55 
 
 		 615 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  44.87 
 
 		 612 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.02 
 
 		 644 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  43.19 
 
 		 1271 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  43.12 
 
 		 1271 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  43.34 
 
 		 678 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.11 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 639 aa  356  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  36.04 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.28 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.69 
 
 		 736 aa  317  7e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  33.67 
 
 		 755 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.67 
 
 		 758 aa  280  8e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.03 
 
 		 828 aa  277  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.27 
 
 		 820 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  29.01 
 
 		 759 aa  261  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.44 
 
 		 762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.59 
 
 		 737 aa  249  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.32 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.19 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.19 
 
 		 723 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.4 
 
 		 752 aa  216  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  29.69 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.86 
 
 		 754 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  29.24 
 
 		 765 aa  211  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  29.24 
 
 		 755 aa  211  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  29.62 
 
 		 772 aa  210  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.04 
 
 		 860 aa  210  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.2 
 
 		 745 aa  210  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  29.09 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.09 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.09 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  29.95 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.73 
 
 		 743 aa  208  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.54 
 
 		 733 aa  208  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 772 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.59 
 
 		 766 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 751 aa  207  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  29.56 
 
 		 750 aa  207  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.51 
 
 		 742 aa  207  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.69 
 
 		 733 aa  206  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  30.4 
 
 		 774 aa  206  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.94 
 
 		 765 aa  204  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.94 
 
 		 765 aa  204  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.94 
 
 		 765 aa  204  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.17 
 
 		 727 aa  203  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.94 
 
 		 765 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 727 aa  202  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  28.79 
 
 		 765 aa  202  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.79 
 
 		 765 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  28.79 
 
 		 765 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.79 
 
 		 765 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  28.64 
 
 		 765 aa  201  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  30.03 
 
 		 759 aa  197  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.55 
 
 		 724 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.57 
 
 		 777 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26742  beta-glucosidase  27.09 
 
 		 953 aa  194  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  28.81 
 
 		 763 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  27.41 
 
 		 778 aa  194  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.96 
 
 		 765 aa  194  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.99 
 
 		 805 aa  194  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.7 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.78 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.05 
 
 		 743 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  29.21 
 
 		 723 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  29.91 
 
 		 790 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  31.85 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  27.18 
 
 		 778 aa  191  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  28.79 
 
 		 764 aa  191  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 		 765 aa  191  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  28.35 
 
 		 763 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  28.79 
 
 		 764 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  28.66 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.19 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3299  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 716 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>