More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4365 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  57.4 
 
 		 599 aa  736    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 608 aa  1257    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.78 
 
 		 900 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  46.35 
 
 		 618 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  43.62 
 
 		 866 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  43.97 
 
 		 900 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.66 
 
 		 615 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  43.24 
 
 		 880 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  42.88 
 
 		 850 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  42.31 
 
 		 862 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  43.54 
 
 		 866 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.97 
 
 		 850 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  43.29 
 
 		 826 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  43.13 
 
 		 826 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  43.13 
 
 		 856 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.88 
 
 		 644 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  43.65 
 
 		 1072 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.34 
 
 		 886 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  40 
 
 		 826 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.32 
 
 		 886 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  43.34 
 
 		 886 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  43.16 
 
 		 886 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  42.29 
 
 		 862 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  40.03 
 
 		 844 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.47 
 
 		 877 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  40.29 
 
 		 811 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.57 
 
 		 619 aa  438  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  40.64 
 
 		 1271 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  41.21 
 
 		 612 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  40.19 
 
 		 1271 aa  422  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  39.38 
 
 		 678 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  41.57 
 
 		 859 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.18 
 
 		 639 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  36.32 
 
 		 605 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 		 736 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.38 
 
 		 739 aa  326  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  32.15 
 
 		 755 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.36 
 
 		 758 aa  289  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.61 
 
 		 820 aa  287  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.55 
 
 		 737 aa  264  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.86 
 
 		 762 aa  264  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.2 
 
 		 828 aa  263  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  29.55 
 
 		 759 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.35 
 
 		 752 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  29.64 
 
 		 774 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  29.9 
 
 		 740 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.5 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.39 
 
 		 750 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.98 
 
 		 743 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  29.55 
 
 		 750 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.33 
 
 		 754 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.1 
 
 		 804 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.62 
 
 		 769 aa  233  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.19 
 
 		 769 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  29.64 
 
 		 723 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  29.06 
 
 		 738 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.79 
 
 		 745 aa  230  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  28.01 
 
 		 727 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.64 
 
 		 733 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  28.01 
 
 		 727 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.77 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  29.37 
 
 		 763 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  28.71 
 
 		 763 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 		 723 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 764 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  29.01 
 
 		 790 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.85 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.84 
 
 		 766 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  28.34 
 
 		 739 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  28.71 
 
 		 763 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  28.55 
 
 		 763 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 753 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  27.89 
 
 		 755 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  28.4 
 
 		 787 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  28.18 
 
 		 740 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  27.89 
 
 		 755 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  27.89 
 
 		 765 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  27.89 
 
 		 755 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  27.89 
 
 		 755 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.1 
 
 		 778 aa  220  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.46 
 
 		 765 aa  219  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.9 
 
 		 724 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  28.43 
 
 		 721 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 		 742 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  28.22 
 
 		 765 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 772 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  27.47 
 
 		 772 aa  218  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.56 
 
 		 778 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 751 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.37 
 
 		 751 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.11 
 
 		 768 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 763 aa  213  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  27.81 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.81 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  27.81 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  28.16 
 
 		 763 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  28.46 
 
 		 759 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.36 
 
 		 759 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  27.81 
 
 		 765 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.28 
 
 		 772 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>