More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2726 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.67 
 
 
850 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  49.17 
 
 
826 aa  736    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  45.81 
 
 
862 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  44.61 
 
 
811 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  44.15 
 
 
862 aa  675    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  46.61 
 
 
850 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  46.44 
 
 
1072 aa  704    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  43.82 
 
 
866 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.65 
 
 
900 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  51.22 
 
 
844 aa  768    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  48.28 
 
 
826 aa  692    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  46.1 
 
 
826 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  44.43 
 
 
880 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  100 
 
 
856 aa  1731    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  45.99 
 
 
886 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  45.99 
 
 
886 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.99 
 
 
886 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.99 
 
 
886 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  43.73 
 
 
900 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  42.66 
 
 
859 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  40.52 
 
 
866 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.51 
 
 
877 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  45.32 
 
 
618 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.34 
 
 
615 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  43.13 
 
 
608 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.84 
 
 
644 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  41.86 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  41.54 
 
 
1271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  41.85 
 
 
1271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  40.92 
 
 
678 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.61 
 
 
612 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 
639 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 
619 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  37.01 
 
 
605 aa  363  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  32.91 
 
 
739 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.31 
 
 
736 aa  317  9e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.34 
 
 
762 aa  262  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  32.65 
 
 
738 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.26 
 
 
737 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  32.92 
 
 
721 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  28.82 
 
 
755 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 
702 aa  247  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.05 
 
 
820 aa  245  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  27.78 
 
 
759 aa  244  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  28.37 
 
 
758 aa  240  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  30.93 
 
 
755 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  30.93 
 
 
765 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 
755 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 
755 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  30.73 
 
 
755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  28.18 
 
 
743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.27 
 
 
733 aa  233  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  29.87 
 
 
765 aa  232  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  29.87 
 
 
765 aa  232  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  29.66 
 
 
750 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  29.87 
 
 
765 aa  232  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  29.87 
 
 
765 aa  232  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  29.93 
 
 
765 aa  230  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.73 
 
 
765 aa  230  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.12 
 
 
754 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  29.73 
 
 
765 aa  230  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  30.03 
 
 
772 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.16 
 
 
752 aa  229  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.41 
 
 
766 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.15 
 
 
828 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  30.05 
 
 
765 aa  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 
751 aa  228  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  29.83 
 
 
765 aa  227  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.63 
 
 
804 aa  225  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.88 
 
 
860 aa  224  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  28.57 
 
 
740 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 
764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.5 
 
 
714 aa  221  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
772 aa  218  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.37 
 
 
769 aa  218  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.46 
 
 
733 aa  217  5.9999999999999996e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.1 
 
 
745 aa  217  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 
753 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.26 
 
 
768 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  28.16 
 
 
750 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.23 
 
 
766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  30.56 
 
 
723 aa  214  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.12 
 
 
749 aa  213  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  29.2 
 
 
765 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.68 
 
 
743 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.56 
 
 
727 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.56 
 
 
727 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.37 
 
 
762 aa  208  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.19 
 
 
759 aa  207  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  28.49 
 
 
739 aa  206  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.91 
 
 
768 aa  205  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
763 aa  205  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  28.82 
 
 
740 aa  205  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.35 
 
 
723 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.83 
 
 
742 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  28.57 
 
 
763 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  28.72 
 
 
764 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  29.13 
 
 
763 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  30.62 
 
 
765 aa  204  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.1 
 
 
765 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>