More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2072 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  48.53 
 
 		 850 aa  764    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 900 aa  1831    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  44.73 
 
 		 826 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  46.34 
 
 		 866 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  46.27 
 
 		 862 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  47.46 
 
 		 1072 aa  702    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  46.78 
 
 		 866 aa  745    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  47.17 
 
 		 826 aa  705    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  44.33 
 
 		 862 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  50.87 
 
 		 900 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  47.51 
 
 		 880 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  43.96 
 
 		 856 aa  671    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  47.54 
 
 		 844 aa  730    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  47.68 
 
 		 850 aa  723    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.17 
 
 		 886 aa  732    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  49.12 
 
 		 886 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.12 
 
 		 886 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.18 
 
 		 877 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  49.12 
 
 		 886 aa  736    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  45.92 
 
 		 859 aa  618  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  42.12 
 
 		 826 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  40.65 
 
 		 811 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  48.04 
 
 		 618 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  45.78 
 
 		 608 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  44.37 
 
 		 599 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.03 
 
 		 615 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.67 
 
 		 644 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  44.92 
 
 		 612 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  43.23 
 
 		 1271 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  41.99 
 
 		 1271 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.75 
 
 		 619 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  42.31 
 
 		 678 aa  406  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  38.72 
 
 		 605 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.24 
 
 		 639 aa  360  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.7 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 736 aa  318  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.24 
 
 		 762 aa  302  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  33.54 
 
 		 755 aa  302  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.88 
 
 		 758 aa  299  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  29.93 
 
 		 759 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.59 
 
 		 820 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 		 702 aa  270  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.37 
 
 		 750 aa  268  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.58 
 
 		 737 aa  263  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 		 752 aa  253  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 		 860 aa  249  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 828 aa  247  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.51 
 
 		 754 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.51 
 
 		 769 aa  237  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.73 
 
 		 804 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  31.01 
 
 		 738 aa  234  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.45 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  30.2 
 
 		 740 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.54 
 
 		 766 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.87 
 
 		 733 aa  232  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  28.82 
 
 		 750 aa  231  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.31 
 
 		 727 aa  230  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  27.84 
 
 		 765 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  27.84 
 
 		 765 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  27.84 
 
 		 765 aa  230  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.46 
 
 		 743 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 		 721 aa  230  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.31 
 
 		 727 aa  230  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  27.94 
 
 		 765 aa  230  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  28.89 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.7 
 
 		 769 aa  229  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  28.89 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.15 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  28.89 
 
 		 755 aa  229  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.71 
 
 		 765 aa  228  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.15 
 
 		 765 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  27.71 
 
 		 765 aa  228  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  28.49 
 
 		 765 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  28.89 
 
 		 755 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.26 
 
 		 765 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.26 
 
 		 768 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 		 772 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  30.88 
 
 		 764 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  29.87 
 
 		 774 aa  225  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.41 
 
 		 766 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.65 
 
 		 768 aa  223  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  30.32 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  27.7 
 
 		 772 aa  223  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.51 
 
 		 768 aa  221  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  28.14 
 
 		 787 aa  220  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.9 
 
 		 765 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.94 
 
 		 733 aa  219  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.89 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 753 aa  218  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  28.53 
 
 		 723 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  29.02 
 
 		 765 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.32 
 
 		 745 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  30.12 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.38 
 
 		 743 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.49 
 
 		 714 aa  215  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.74 
 
 		 749 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 763 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 764 aa  211  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  28.25 
 
 		 743 aa  210  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.43 
 
 		 765 aa  210  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>