More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00680 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  49.76 
 
 		 886 aa  776    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  51.75 
 
 		 826 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  48 
 
 		 811 aa  724    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  47.07 
 
 		 862 aa  763    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  48.65 
 
 		 1072 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  49.18 
 
 		 866 aa  796    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  52.34 
 
 		 826 aa  841    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  48.5 
 
 		 826 aa  739    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  100 
 
 		 844 aa  1720    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  47.36 
 
 		 862 aa  769    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  48.89 
 
 		 880 aa  777    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  49.82 
 
 		 856 aa  772    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  49.51 
 
 		 886 aa  772    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.97 
 
 		 850 aa  744    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.76 
 
 		 886 aa  777    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  48.76 
 
 		 850 aa  787    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.54 
 
 		 900 aa  731    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.69 
 
 		 886 aa  773    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  43.38 
 
 		 859 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 900 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  39.43 
 
 		 866 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.34 
 
 		 877 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  44.91 
 
 		 618 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.87 
 
 		 615 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.54 
 
 		 644 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  40.38 
 
 		 608 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  39.29 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.22 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  39.9 
 
 		 1271 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  39.19 
 
 		 1271 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.06 
 
 		 612 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  38.41 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  38.24 
 
 		 605 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 		 639 aa  357  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  31.11 
 
 		 739 aa  331  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.57 
 
 		 736 aa  327  8.000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.98 
 
 		 762 aa  302  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  31.16 
 
 		 755 aa  297  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  30.21 
 
 		 759 aa  279  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  30.32 
 
 		 758 aa  279  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  29.72 
 
 		 750 aa  277  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.06 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.79 
 
 		 702 aa  263  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  31.33 
 
 		 737 aa  263  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  30.95 
 
 		 750 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.13 
 
 		 828 aa  258  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  31.87 
 
 		 738 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.13 
 
 		 754 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.65 
 
 		 745 aa  244  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  30.7 
 
 		 721 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.31 
 
 		 733 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.4 
 
 		 723 aa  237  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 		 764 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.38 
 
 		 727 aa  234  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.38 
 
 		 727 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.4 
 
 		 752 aa  233  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.38 
 
 		 749 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  28.16 
 
 		 740 aa  231  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.98 
 
 		 743 aa  228  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.18 
 
 		 766 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.41 
 
 		 742 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 751 aa  224  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  29.17 
 
 		 723 aa  221  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.68 
 
 		 804 aa  220  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  27.01 
 
 		 743 aa  220  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 		 733 aa  220  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  29.12 
 
 		 765 aa  219  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  28.97 
 
 		 765 aa  218  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.97 
 
 		 765 aa  218  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  28.97 
 
 		 765 aa  218  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 		 714 aa  218  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 		 772 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  29.94 
 
 		 768 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.65 
 
 		 755 aa  217  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  28.44 
 
 		 772 aa  217  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  29.65 
 
 		 755 aa  217  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.81 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.81 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.97 
 
 		 765 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.67 
 
 		 765 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  29.48 
 
 		 755 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.49 
 
 		 755 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  29.48 
 
 		 765 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.81 
 
 		 765 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.44 
 
 		 769 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  30.3 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  29.54 
 
 		 759 aa  213  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.68 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  27.85 
 
 		 787 aa  212  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  27.2 
 
 		 760 aa  212  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  28.92 
 
 		 764 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  26.47 
 
 		 765 aa  211  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.59 
 
 		 766 aa  211  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.25 
 
 		 762 aa  209  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 805 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  28.42 
 
 		 764 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.33 
 
 		 756 aa  207  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  28.11 
 
 		 765 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 753 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.71 
 
 		 780 aa  206  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>