More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2365 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  100 
 
 		 759 aa  1549    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  51.85 
 
 		 758 aa  772    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  52.28 
 
 		 820 aa  781    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  47.56 
 
 		 750 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  46.61 
 
 		 755 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  39.53 
 
 		 739 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 		 736 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 763 aa  428  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  34.08 
 
 		 743 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.05 
 
 		 766 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 762 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  33.56 
 
 		 721 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.61 
 
 		 772 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.14 
 
 		 756 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.2 
 
 		 772 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.4 
 
 		 763 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.53 
 
 		 763 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  31.78 
 
 		 737 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.9 
 
 		 769 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 766 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.15 
 
 		 763 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.9 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  32.15 
 
 		 763 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  33.51 
 
 		 755 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.9 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.9 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.77 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  33.03 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.51 
 
 		 755 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  33.38 
 
 		 765 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  33.97 
 
 		 738 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  35.96 
 
 		 778 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.63 
 
 		 765 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.77 
 
 		 765 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.38 
 
 		 755 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.77 
 
 		 765 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.35 
 
 		 772 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  33.12 
 
 		 765 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.16 
 
 		 774 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  33.64 
 
 		 750 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.38 
 
 		 755 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  35.42 
 
 		 778 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.77 
 
 		 765 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.15 
 
 		 765 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 		 753 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.92 
 
 		 769 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 768 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  32.8 
 
 		 740 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.07 
 
 		 768 aa  379  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.93 
 
 		 751 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.51 
 
 		 702 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.79 
 
 		 765 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34 
 
 		 762 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.91 
 
 		 777 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.69 
 
 		 752 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26742  beta-glucosidase  32.44 
 
 		 953 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.77 
 
 		 828 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.49 
 
 		 745 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  30.84 
 
 		 768 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.73 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.81 
 
 		 790 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.33 
 
 		 771 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  34.61 
 
 		 740 aa  360  4e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  34.29 
 
 		 739 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.53 
 
 		 860 aa  360  8e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 		 615 aa  360  8e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  34.23 
 
 		 723 aa  360  8e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 		 807 aa  359  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.93 
 
 		 754 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 		 805 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.55 
 
 		 782 aa  356  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  33.51 
 
 		 765 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  31.22 
 
 		 764 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  30.74 
 
 		 764 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 751 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.7 
 
 		 751 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 		 749 aa  346  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  34.24 
 
 		 759 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 		 795 aa  340  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.85 
 
 		 792 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 		 618 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.98 
 
 		 759 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.48 
 
 		 724 aa  333  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 		 743 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.08 
 
 		 765 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.21 
 
 		 808 aa  330  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.44 
 
 		 787 aa  329  9e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  30.68 
 
 		 763 aa  327  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.21 
 
 		 733 aa  326  9e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  31.85 
 
 		 759 aa  326  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.63 
 
 		 773 aa  325  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.12 
 
 		 742 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.33 
 
 		 760 aa  323  6e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 		 760 aa  323  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.09 
 
 		 733 aa  323  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.78 
 
 		 727 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.78 
 
 		 727 aa  321  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 		 801 aa  320  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 		 760 aa  319  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>