More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2616 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  54.8 
 
 		 618 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 615 aa  1251    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.74 
 
 		 644 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  53.7 
 
 		 612 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  53.79 
 
 		 1271 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  52.95 
 
 		 1271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.68 
 
 		 619 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  48.45 
 
 		 678 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  45.66 
 
 		 608 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.03 
 
 		 900 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  43.87 
 
 		 844 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  46.59 
 
 		 826 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  43.75 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  45.34 
 
 		 856 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  43.51 
 
 		 1072 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  47.39 
 
 		 826 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  44.12 
 
 		 826 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.83 
 
 		 850 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  45.78 
 
 		 811 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  46.15 
 
 		 850 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 		 900 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  42.92 
 
 		 866 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  44.21 
 
 		 605 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  43.11 
 
 		 862 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  45.34 
 
 		 880 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.92 
 
 		 877 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  44.59 
 
 		 866 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  44.54 
 
 		 862 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.93 
 
 		 886 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.26 
 
 		 886 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  44.93 
 
 		 886 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  45.09 
 
 		 886 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  40.16 
 
 		 739 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.5 
 
 		 639 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.97 
 
 		 736 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  39.18 
 
 		 859 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  34.68 
 
 		 758 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.43 
 
 		 762 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  34.48 
 
 		 755 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  33.86 
 
 		 759 aa  360  6e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  33.28 
 
 		 820 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  33.73 
 
 		 750 aa  348  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 		 828 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  36.26 
 
 		 737 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.11 
 
 		 754 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 		 750 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  33.99 
 
 		 743 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.89 
 
 		 743 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.48 
 
 		 702 aa  313  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  32.29 
 
 		 740 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.13 
 
 		 772 aa  312  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.23 
 
 		 752 aa  310  5.9999999999999995e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.21 
 
 		 774 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.09 
 
 		 804 aa  308  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  32.85 
 
 		 766 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.8 
 
 		 765 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 		 753 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.54 
 
 		 723 aa  302  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  34.54 
 
 		 721 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  33.58 
 
 		 790 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.49 
 
 		 751 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  34.84 
 
 		 738 aa  297  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  33.85 
 
 		 763 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 772 aa  296  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  33.84 
 
 		 763 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  33.84 
 
 		 763 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 765 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  34.79 
 
 		 727 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  34.79 
 
 		 727 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.24 
 
 		 755 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  31.93 
 
 		 755 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  33.23 
 
 		 763 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 		 714 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 		 762 aa  290  7e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.58 
 
 		 765 aa  289  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.13 
 
 		 768 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 805 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 763 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.32 
 
 		 766 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.36 
 
 		 769 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.51 
 
 		 782 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.26 
 
 		 749 aa  283  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.23 
 
 		 778 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  32.04 
 
 		 759 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 751 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.09 
 
 		 765 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.09 
 
 		 765 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.09 
 
 		 765 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 		 764 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  33.7 
 
 		 763 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  33.44 
 
 		 723 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.93 
 
 		 765 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 		 765 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.93 
 
 		 765 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 772 aa  281  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.93 
 
 		 765 aa  281  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.93 
 
 		 765 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  31.75 
 
 		 765 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>