More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1689 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
619 aa  1259    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.85 
 
 
644 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  50.72 
 
 
618 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.68 
 
 
615 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  48.28 
 
 
612 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  49.5 
 
 
1271 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  47.44 
 
 
678 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  47.43 
 
 
1271 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  43.57 
 
 
608 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.25 
 
 
900 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  42.86 
 
 
866 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  41.8 
 
 
880 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  42.37 
 
 
850 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  42.65 
 
 
850 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.9 
 
 
736 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  41.07 
 
 
605 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  40.35 
 
 
844 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  41.44 
 
 
1072 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  43.11 
 
 
900 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  41.8 
 
 
886 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.16 
 
 
886 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  41.8 
 
 
886 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.8 
 
 
886 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  41.48 
 
 
826 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  38.24 
 
 
599 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.41 
 
 
877 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  38.83 
 
 
862 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  38.19 
 
 
862 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 
866 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  40 
 
 
856 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  41.04 
 
 
826 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.58 
 
 
639 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  41.2 
 
 
826 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  38.07 
 
 
811 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.92 
 
 
739 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  38.84 
 
 
859 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.9 
 
 
762 aa  346  8e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  33.16 
 
 
758 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  34.84 
 
 
737 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.73 
 
 
828 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.49 
 
 
702 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  31.9 
 
 
759 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.05 
 
 
820 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  31.41 
 
 
750 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.33 
 
 
754 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  32.21 
 
 
755 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.52 
 
 
807 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.34 
 
 
727 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  31.34 
 
 
727 aa  273  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.66 
 
 
743 aa  270  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.13 
 
 
777 aa  269  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 
772 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  29.92 
 
 
740 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  31.69 
 
 
765 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  32.54 
 
 
750 aa  263  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 
764 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.81 
 
 
766 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 
723 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 
753 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.83 
 
 
790 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 
804 aa  254  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 
766 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  31.9 
 
 
723 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.82 
 
 
733 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 
742 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.88 
 
 
765 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.13 
 
 
774 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.69 
 
 
745 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  32.2 
 
 
768 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.97 
 
 
757 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.7 
 
 
749 aa  249  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  33.17 
 
 
739 aa  249  9e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  33 
 
 
740 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  30.21 
 
 
738 aa  247  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.24 
 
 
860 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 
763 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  30.05 
 
 
759 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 
762 aa  243  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.64 
 
 
751 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  32.64 
 
 
721 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
751 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 
795 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.59 
 
 
771 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
763 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  30.28 
 
 
763 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 
769 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.81 
 
 
752 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  30.64 
 
 
765 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.81 
 
 
778 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 
805 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.05 
 
 
751 aa  240  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
763 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.68 
 
 
778 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 
743 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.62 
 
 
743 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  29.81 
 
 
763 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  31.59 
 
 
759 aa  238  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.53 
 
 
765 aa  236  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 
743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.53 
 
 
859 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>