More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1599 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  78.76 
 
 
717 aa  1171    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
714 aa  1464    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  55.28 
 
 
708 aa  797    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  66.1 
 
 
722 aa  974    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  54.7 
 
 
701 aa  774    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  66.1 
 
 
721 aa  983    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  49.93 
 
 
814 aa  699    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  41.08 
 
 
793 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  40.94 
 
 
793 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.06 
 
 
749 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  40.97 
 
 
755 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.06 
 
 
758 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.22 
 
 
755 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  40.28 
 
 
762 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.94 
 
 
757 aa  432  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.01 
 
 
750 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 
747 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  35.54 
 
 
800 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 
745 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.08 
 
 
790 aa  399  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.34 
 
 
777 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 
751 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.04 
 
 
737 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.33 
 
 
750 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  35.78 
 
 
740 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 
734 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.75 
 
 
813 aa  389  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  35.51 
 
 
757 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.96 
 
 
742 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
780 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  34.79 
 
 
760 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.83 
 
 
741 aa  376  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.98 
 
 
757 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 
721 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 
711 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.82 
 
 
809 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.45 
 
 
748 aa  357  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.28 
 
 
758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.23 
 
 
738 aa  353  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  34.9 
 
 
874 aa  353  7e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  33.19 
 
 
691 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  32.06 
 
 
748 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  32.7 
 
 
731 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  31.43 
 
 
748 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  32.47 
 
 
922 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
733 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
733 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
733 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  32.17 
 
 
731 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  31.21 
 
 
685 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  32.29 
 
 
731 aa  320  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.99 
 
 
746 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  32.47 
 
 
733 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  32.6 
 
 
733 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  32.69 
 
 
735 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  32.38 
 
 
733 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  32.37 
 
 
733 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  31.54 
 
 
737 aa  303  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.36 
 
 
724 aa  301  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  30.49 
 
 
716 aa  296  7e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  33.14 
 
 
987 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.19 
 
 
933 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.72 
 
 
1321 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.88 
 
 
756 aa  291  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  31.48 
 
 
751 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.39 
 
 
814 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  30.76 
 
 
737 aa  289  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  31.21 
 
 
751 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  31.21 
 
 
751 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  30.66 
 
 
748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  30.83 
 
 
779 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  31.71 
 
 
693 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  39.59 
 
 
845 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  29.25 
 
 
829 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.04 
 
 
762 aa  277  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.1 
 
 
1072 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  39.64 
 
 
823 aa  273  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.32 
 
 
778 aa  270  7e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.08 
 
 
777 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
805 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.04 
 
 
778 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  30.74 
 
 
868 aa  266  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.584678 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  27.71 
 
 
772 aa  265  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  28.39 
 
 
822 aa  264  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  28.48 
 
 
731 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.85 
 
 
820 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.84 
 
 
818 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  28.27 
 
 
819 aa  262  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  38.13 
 
 
749 aa  260  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  37.53 
 
 
915 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  37.6 
 
 
914 aa  254  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  37.88 
 
 
833 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  35.7 
 
 
738 aa  252  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  35.44 
 
 
738 aa  251  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  36.99 
 
 
839 aa  250  8e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  37.83 
 
 
851 aa  247  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.07 
 
 
795 aa  243  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29 
 
 
760 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  29.36 
 
 
808 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.03 
 
 
784 aa  238  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>