More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 809 aa  1609    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  61.78 
 
 		 813 aa  899    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  42.3 
 
 		 762 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.11 
 
 		 755 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  44.63 
 
 		 800 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  42.93 
 
 		 755 aa  625  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.29 
 
 		 790 aa  615  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.23 
 
 		 757 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.16 
 
 		 758 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.16 
 
 		 749 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  49.48 
 
 		 750 aa  598  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.4 
 
 		 750 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.07 
 
 		 742 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.31 
 
 		 751 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  50.22 
 
 		 760 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  45.33 
 
 		 747 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  48.69 
 
 		 740 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  45.96 
 
 		 757 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.25 
 
 		 758 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.59 
 
 		 777 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  45.24 
 
 		 749 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  39.25 
 
 		 874 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.09 
 
 		 748 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  41.73 
 
 		 741 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.09 
 
 		 737 aa  524  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.43 
 
 		 737 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.51 
 
 		 780 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.3 
 
 		 745 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  35.18 
 
 		 793 aa  412  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  35.04 
 
 		 793 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 		 734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.59 
 
 		 721 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.23 
 
 		 716 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  37.99 
 
 		 721 aa  405  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.44 
 
 		 708 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  35.91 
 
 		 814 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.85 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.59 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.45 
 
 		 738 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  38.47 
 
 		 701 aa  382  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.95 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.9 
 
 		 711 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.63 
 
 		 933 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.2 
 
 		 757 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.86 
 
 		 731 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  38.19 
 
 		 987 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  39.33 
 
 		 691 aa  345  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.93 
 
 		 1072 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  37.33 
 
 		 731 aa  333  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.02 
 
 		 497 aa  332  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 		 1158 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.09 
 
 		 685 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 737 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  39.16 
 
 		 693 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  34.28 
 
 		 730 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 733 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 733 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 733 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 		 756 aa  301  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  35.1 
 
 		 748 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.77 
 
 		 724 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  35.14 
 
 		 748 aa  296  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  34.45 
 
 		 733 aa  296  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  34.86 
 
 		 727 aa  296  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.79 
 
 		 1338 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  34.76 
 
 		 733 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.06 
 
 		 731 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 		 1321 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34.65 
 
 		 733 aa  291  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.51 
 
 		 733 aa  290  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.16 
 
 		 731 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.42 
 
 		 922 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.55 
 
 		 829 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  35.23 
 
 		 779 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  35.58 
 
 		 751 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  35.58 
 
 		 751 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 748 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  35.13 
 
 		 751 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.13 
 
 		 822 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  42.82 
 
 		 845 aa  274  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.58 
 
 		 814 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  32.77 
 
 		 735 aa  273  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.07 
 
 		 772 aa  271  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  45.05 
 
 		 818 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.92 
 
 		 778 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  42.28 
 
 		 914 aa  267  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.77 
 
 		 778 aa  266  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  42.94 
 
 		 915 aa  260  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.57 
 
 		 820 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  40 
 
 		 851 aa  258  5e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  30.79 
 
 		 737 aa  257  7e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  42.45 
 
 		 823 aa  254  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  31.74 
 
 		 747 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  40.11 
 
 		 831 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  40.62 
 
 		 836 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.49 
 
 		 790 aa  251  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 		 754 aa  251  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.36 
 
 		 712 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  29.71 
 
 		 772 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.09 
 
 		 771 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>