More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3392 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  53.45 
 
 
721 aa  754    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  49.93 
 
 
714 aa  699    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  48.5 
 
 
708 aa  647    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  52.65 
 
 
722 aa  738    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  46.42 
 
 
701 aa  659    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  50.07 
 
 
717 aa  719    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
814 aa  1654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  38.77 
 
 
793 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  38.64 
 
 
793 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.91 
 
 
755 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.72 
 
 
758 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.67 
 
 
749 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.24 
 
 
750 aa  445  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.95 
 
 
757 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  38.65 
 
 
762 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 
755 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.14 
 
 
750 aa  429  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  36.94 
 
 
800 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  36.13 
 
 
740 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.06 
 
 
734 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.33 
 
 
747 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  36.92 
 
 
757 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  35.37 
 
 
749 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.86 
 
 
813 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 
748 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.42 
 
 
760 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.5 
 
 
777 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.06 
 
 
745 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  35.61 
 
 
738 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35 
 
 
742 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 
780 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.6 
 
 
809 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.8 
 
 
790 aa  379  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 
721 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.58 
 
 
737 aa  372  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.35 
 
 
741 aa  372  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 
711 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 
751 aa  365  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 
758 aa  356  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  33.28 
 
 
874 aa  354  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  32.28 
 
 
685 aa  343  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.19 
 
 
757 aa  342  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  33.47 
 
 
731 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  32.6 
 
 
691 aa  332  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  32.38 
 
 
748 aa  330  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  32.11 
 
 
733 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  32.11 
 
 
733 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  31.88 
 
 
733 aa  327  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  32.06 
 
 
733 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  32.66 
 
 
733 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  32.12 
 
 
748 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  32.25 
 
 
733 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  31.66 
 
 
733 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.43 
 
 
933 aa  316  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  32.05 
 
 
716 aa  313  5.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  32.54 
 
 
730 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.83 
 
 
1072 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  31.67 
 
 
922 aa  307  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  31.08 
 
 
731 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  31.56 
 
 
735 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  29.2 
 
 
727 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.74 
 
 
724 aa  301  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 
756 aa  300  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 
746 aa  300  7e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.07 
 
 
762 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  30.03 
 
 
731 aa  296  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  28.66 
 
 
829 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  31.4 
 
 
737 aa  294  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.89 
 
 
1321 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.76 
 
 
805 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  29.46 
 
 
731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  31.01 
 
 
693 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  32.62 
 
 
987 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.94 
 
 
757 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  40.73 
 
 
845 aa  274  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.86 
 
 
777 aa  274  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  29.82 
 
 
808 aa  273  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  30.43 
 
 
748 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  29.06 
 
 
737 aa  271  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  30.43 
 
 
751 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.21 
 
 
778 aa  271  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  30.29 
 
 
751 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  30.29 
 
 
751 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.3 
 
 
743 aa  270  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  38.4 
 
 
914 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  30.78 
 
 
779 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.84 
 
 
778 aa  268  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.82 
 
 
760 aa  267  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  28.59 
 
 
819 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.35 
 
 
1338 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  38.21 
 
 
915 aa  264  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.41 
 
 
814 aa  263  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  41.64 
 
 
823 aa  262  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.69 
 
 
801 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.01 
 
 
769 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.8 
 
 
1158 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  29.57 
 
 
738 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.41 
 
 
771 aa  255  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  27.46 
 
 
772 aa  253  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.03 
 
 
766 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>