More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6257 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.76 
 
 		 814 aa  714    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  52.07 
 
 		 915 aa  810    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  49.7 
 
 		 836 aa  782    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  100 
 
 		 823 aa  1682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  71.76 
 
 		 820 aa  1209    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  51.65 
 
 		 914 aa  816    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  43.2 
 
 		 845 aa  620  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  38.22 
 
 		 843 aa  572  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  38.41 
 
 		 833 aa  568  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  39.25 
 
 		 851 aa  562  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  39.28 
 
 		 843 aa  563  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  38.56 
 
 		 839 aa  553  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  37.47 
 
 		 838 aa  543  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  37.83 
 
 		 850 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  36.44 
 
 		 831 aa  527  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  36.96 
 
 		 852 aa  523  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  39.81 
 
 		 832 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  38.13 
 
 		 738 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  37.73 
 
 		 738 aa  502  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.68 
 
 		 818 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  35.79 
 
 		 866 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.56 
 
 		 820 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  35.01 
 
 		 857 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  33.89 
 
 		 832 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.51 
 
 		 813 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  33.1 
 
 		 870 aa  449  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  36.56 
 
 		 805 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  33.65 
 
 		 887 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.03 
 
 		 839 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.75 
 
 		 874 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  31.18 
 
 		 913 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 913 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  30.92 
 
 		 913 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  31.78 
 
 		 884 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  31.19 
 
 		 897 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  30.68 
 
 		 906 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  35.44 
 
 		 927 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  33.46 
 
 		 816 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  32.98 
 
 		 897 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  31.32 
 
 		 772 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  34.65 
 
 		 578 aa  354  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.09 
 
 		 966 aa  353  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.47 
 
 		 904 aa  350  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  30.43 
 
 		 886 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.63 
 
 		 757 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.3 
 
 		 758 aa  318  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.3 
 
 		 749 aa  318  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.79 
 
 		 755 aa  317  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  43.08 
 
 		 749 aa  306  8.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.15 
 
 		 750 aa  306  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  44.02 
 
 		 800 aa  300  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  43.63 
 
 		 762 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  44.81 
 
 		 747 aa  297  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  45.86 
 
 		 750 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  44.14 
 
 		 740 aa  295  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  44.54 
 
 		 755 aa  294  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  43.7 
 
 		 708 aa  291  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.97 
 
 		 748 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  42.35 
 
 		 721 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.41 
 
 		 777 aa  288  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  41.84 
 
 		 722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.08 
 
 		 711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  31.46 
 
 		 902 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.04 
 
 		 751 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  28.64 
 
 		 875 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.95 
 
 		 790 aa  280  6e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  29.65 
 
 		 882 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  43.75 
 
 		 701 aa  280  7e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  29.65 
 
 		 882 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  39.19 
 
 		 717 aa  278  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.75 
 
 		 737 aa  278  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  42.75 
 
 		 760 aa  277  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  40.21 
 
 		 716 aa  276  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.99 
 
 		 734 aa  273  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.3 
 
 		 813 aa  273  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  39.64 
 
 		 714 aa  273  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  41.42 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.88 
 
 		 742 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 		 988 aa  270  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  34.68 
 
 		 895 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.72 
 
 		 780 aa  269  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.66 
 
 		 741 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  41.6 
 
 		 793 aa  266  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  41.33 
 
 		 793 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.13 
 
 		 757 aa  265  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  38.05 
 
 		 745 aa  263  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  29.26 
 
 		 889 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  41.64 
 
 		 814 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  27.71 
 
 		 972 aa  262  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.82 
 
 		 881 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.83 
 
 		 737 aa  259  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  29.21 
 
 		 849 aa  256  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.58 
 
 		 758 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  38.24 
 
 		 721 aa  254  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.06 
 
 		 893 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.39 
 
 		 927 aa  252  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 		 746 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.45 
 
 		 809 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.75 
 
 		 738 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  28.18 
 
 		 898 aa  240  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>