More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1022 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.82 
 
 		 750 aa  717    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.36 
 
 		 758 aa  666    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  52.06 
 
 		 777 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  51.54 
 
 		 740 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.29 
 
 		 755 aa  696    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.03 
 
 		 742 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  51.05 
 
 		 760 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  45.43 
 
 		 762 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  50.79 
 
 		 750 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 758 aa  1500    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  46.25 
 
 		 755 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.59 
 
 		 757 aa  662    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.61 
 
 		 749 aa  679    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.89 
 
 		 751 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  46.76 
 
 		 800 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.41 
 
 		 748 aa  621  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  46.27 
 
 		 757 aa  618  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.09 
 
 		 737 aa  615  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  43.7 
 
 		 747 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.96 
 
 		 737 aa  585  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  41.7 
 
 		 741 aa  585  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.07 
 
 		 790 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  44.43 
 
 		 749 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  51.25 
 
 		 809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.15 
 
 		 813 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.42 
 
 		 780 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  45.23 
 
 		 874 aa  538  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.57 
 
 		 745 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.99 
 
 		 721 aa  428  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  40.89 
 
 		 701 aa  427  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  36.2 
 
 		 793 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  36.2 
 
 		 793 aa  426  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  38.31 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.43 
 
 		 734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.24 
 
 		 711 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.56 
 
 		 721 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.65 
 
 		 722 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.54 
 
 		 716 aa  396  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  34.01 
 
 		 814 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.37 
 
 		 1072 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  34.99 
 
 		 717 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.37 
 
 		 714 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  35.57 
 
 		 738 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.35 
 
 		 933 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.96 
 
 		 757 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.13 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  40.98 
 
 		 987 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  35.03 
 
 		 731 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  37 
 
 		 731 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.14 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  36.39 
 
 		 731 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.66 
 
 		 1158 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  36.24 
 
 		 922 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 		 685 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  36.78 
 
 		 737 aa  329  9e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  36.56 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  36.56 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  36.56 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  39.29 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  36.65 
 
 		 748 aa  327  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 		 756 aa  326  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  39.94 
 
 		 779 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  36.12 
 
 		 733 aa  324  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  35.98 
 
 		 733 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  36.93 
 
 		 735 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  40.68 
 
 		 748 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  39.94 
 
 		 751 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  39.94 
 
 		 751 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  39.94 
 
 		 751 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  35.83 
 
 		 733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  37.99 
 
 		 691 aa  319  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  36.12 
 
 		 733 aa  319  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  35.97 
 
 		 727 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  35.66 
 
 		 748 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.79 
 
 		 737 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.98 
 
 		 772 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.23 
 
 		 829 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  35.54 
 
 		 730 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 		 1321 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 		 778 aa  294  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.91 
 
 		 760 aa  294  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 		 778 aa  292  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.89 
 
 		 762 aa  291  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 731 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 		 755 aa  291  5.0000000000000004e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  31.62 
 
 		 819 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.49 
 
 		 822 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.15 
 
 		 777 aa  288  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.32 
 
 		 790 aa  288  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 805 aa  287  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 		 783 aa  286  9e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  34.01 
 
 		 931 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  43.54 
 
 		 914 aa  281  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.18 
 
 		 814 aa  280  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.93 
 
 		 820 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  43.58 
 
 		 823 aa  276  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  35.14 
 
 		 764 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  33.88 
 
 		 905 aa  276  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  32.66 
 
 		 1338 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  32.87 
 
 		 766 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>