More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3288 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  54.24 
 
 
748 aa  719    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  55.8 
 
 
691 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  50.83 
 
 
735 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  54.58 
 
 
748 aa  694    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  54.91 
 
 
737 aa  736    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  49.86 
 
 
731 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  100 
 
 
730 aa  1470    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  48.87 
 
 
931 aa  631  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  46.15 
 
 
731 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  43.66 
 
 
733 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  43.66 
 
 
733 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  43.66 
 
 
733 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  43.8 
 
 
733 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  44.08 
 
 
733 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  43.8 
 
 
733 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  43.66 
 
 
733 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  41.85 
 
 
731 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  40.78 
 
 
922 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  44.79 
 
 
751 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  45.27 
 
 
779 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  44.79 
 
 
751 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  40.91 
 
 
731 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  44.65 
 
 
751 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  43.26 
 
 
748 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.6 
 
 
933 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.8 
 
 
749 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.35 
 
 
758 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  40.9 
 
 
693 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.02 
 
 
734 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.86 
 
 
1072 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.3 
 
 
755 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.25 
 
 
721 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.41 
 
 
711 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  35.99 
 
 
755 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  34.69 
 
 
745 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  34.34 
 
 
829 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.91 
 
 
738 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  34.87 
 
 
762 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.92 
 
 
987 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 
1158 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 
790 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 
757 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 
800 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 
747 aa  357  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.82 
 
 
757 aa  347  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.84 
 
 
737 aa  346  7e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.48 
 
 
740 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 
721 aa  332  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 
714 aa  330  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.93 
 
 
746 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.41 
 
 
741 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35 
 
 
750 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.52 
 
 
1321 aa  327  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  32.8 
 
 
814 aa  326  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  33.14 
 
 
716 aa  324  4e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.48 
 
 
750 aa  323  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  33.01 
 
 
722 aa  323  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.48 
 
 
742 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.81 
 
 
1338 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  35.17 
 
 
701 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  33 
 
 
757 aa  312  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 
793 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  31.3 
 
 
793 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  33.81 
 
 
749 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 
762 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.08 
 
 
717 aa  310  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.42 
 
 
813 aa  309  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  31.29 
 
 
685 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 
756 aa  303  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 
708 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.6 
 
 
751 aa  301  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
809 aa  301  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.65 
 
 
777 aa  296  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.4 
 
 
748 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 
780 aa  295  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  36.29 
 
 
760 aa  294  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.44 
 
 
758 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  30.15 
 
 
874 aa  291  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.31 
 
 
737 aa  290  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.87 
 
 
790 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 
724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  41.71 
 
 
549 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.54 
 
 
772 aa  280  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.7 
 
 
743 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.13 
 
 
777 aa  277  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  30.91 
 
 
759 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.13 
 
 
766 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.14 
 
 
822 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  30.96 
 
 
765 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.85 
 
 
737 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  29.96 
 
 
819 aa  266  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32.71 
 
 
905 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  32.13 
 
 
727 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 
772 aa  265  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 
805 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.19 
 
 
771 aa  265  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.69 
 
 
778 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.4 
 
 
778 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  29.91 
 
 
772 aa  261  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  30.89 
 
 
733 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>