More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6143 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1378    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  46.46 
 
 
987 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.41 
 
 
933 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.32 
 
 
1072 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.94 
 
 
1158 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  37.64 
 
 
731 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.55 
 
 
711 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.89 
 
 
758 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.45 
 
 
757 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.89 
 
 
749 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  37.79 
 
 
755 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  36.83 
 
 
762 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  39.35 
 
 
1338 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.44 
 
 
755 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.17 
 
 
1321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  40.63 
 
 
730 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  39.6 
 
 
731 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  39.37 
 
 
733 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  39.37 
 
 
733 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  39.51 
 
 
733 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.06 
 
 
734 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  39.2 
 
 
733 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  38.33 
 
 
922 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  38.55 
 
 
731 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  40.06 
 
 
748 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  35.9 
 
 
819 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  38.78 
 
 
733 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  37.87 
 
 
748 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.4 
 
 
746 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.38 
 
 
757 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  38.89 
 
 
733 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  38.12 
 
 
733 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  34.9 
 
 
800 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  39.85 
 
 
737 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.06 
 
 
790 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  38.85 
 
 
760 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.08 
 
 
738 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  33.15 
 
 
772 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.16 
 
 
747 aa  365  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  36.17 
 
 
737 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.41 
 
 
745 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  34.92 
 
 
822 aa  361  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  36.45 
 
 
735 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  35.04 
 
 
721 aa  352  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  40.58 
 
 
691 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  34.44 
 
 
722 aa  348  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.21 
 
 
829 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.18 
 
 
750 aa  346  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  32.73 
 
 
717 aa  346  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.18 
 
 
777 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  33.66 
 
 
721 aa  343  7e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.22 
 
 
813 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  35.63 
 
 
749 aa  342  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  34.11 
 
 
685 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  33.85 
 
 
716 aa  340  5e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  38.84 
 
 
751 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.12 
 
 
751 aa  339  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 
780 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  38.7 
 
 
751 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  38.7 
 
 
751 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.91 
 
 
741 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.17 
 
 
750 aa  336  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  36.77 
 
 
740 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  38.46 
 
 
779 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  38.59 
 
 
748 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.86 
 
 
793 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.86 
 
 
793 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  35.18 
 
 
708 aa  325  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  35.54 
 
 
757 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  35.28 
 
 
931 aa  324  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  36.49 
 
 
731 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.29 
 
 
758 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.6 
 
 
809 aa  318  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.62 
 
 
742 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  32.83 
 
 
874 aa  318  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  31.91 
 
 
737 aa  316  9e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  35.8 
 
 
701 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.7 
 
 
724 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.62 
 
 
737 aa  313  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  32.55 
 
 
714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.08 
 
 
748 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  35.56 
 
 
854 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  35.13 
 
 
868 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  35.19 
 
 
727 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.01 
 
 
814 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.26 
 
 
756 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06652  beta-glucosidase (Eurofung)  32.79 
 
 
1023 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.76 
 
 
754 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.16 
 
 
782 aa  278  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.32 
 
 
777 aa  270  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  33.51 
 
 
764 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.84 
 
 
743 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.25 
 
 
759 aa  264  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.9 
 
 
784 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.74 
 
 
808 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 
762 aa  261  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 
805 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  30.5 
 
 
765 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37797  beta-glucosidase  33.39 
 
 
814 aa  258  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.472931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  33.11 
 
 
764 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>