More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1256 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.49 
 
 		 755 aa  1070    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.94 
 
 		 790 aa  744    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  45.09 
 
 		 740 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.42 
 
 		 777 aa  691    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  64.4 
 
 		 762 aa  1055    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  48.41 
 
 		 749 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  45.91 
 
 		 757 aa  660    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  46.79 
 
 		 737 aa  685    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  45.29 
 
 		 741 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  44.7 
 
 		 750 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.73 
 
 		 750 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  52.75 
 
 		 747 aa  815    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.89 
 
 		 742 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 755 aa  1555    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.94 
 
 		 751 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.06 
 
 		 749 aa  1028    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  63.34 
 
 		 758 aa  1003    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.37 
 
 		 757 aa  852    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  46.6 
 
 		 800 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.25 
 
 		 758 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  44.72 
 
 		 760 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  40.88 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.12 
 
 		 813 aa  598  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.6 
 
 		 809 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.95 
 
 		 737 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.37 
 
 		 748 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.72 
 
 		 780 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.62 
 
 		 734 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  42.3 
 
 		 738 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  39.92 
 
 		 793 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  39.79 
 
 		 793 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  40.26 
 
 		 745 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  42.45 
 
 		 722 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  42.93 
 
 		 721 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.8 
 
 		 711 aa  485  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  39.02 
 
 		 721 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  41.23 
 
 		 701 aa  480  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  41.23 
 
 		 708 aa  479  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  40.97 
 
 		 714 aa  472  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  40.69 
 
 		 717 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.62 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.49 
 
 		 757 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  36.83 
 
 		 716 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.08 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.35 
 
 		 933 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.37 
 
 		 756 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  38.82 
 
 		 987 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  35.75 
 
 		 731 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  35.75 
 
 		 733 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  35.75 
 
 		 733 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  35.75 
 
 		 733 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.32 
 
 		 693 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.45 
 
 		 1072 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  35.21 
 
 		 922 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  35.66 
 
 		 733 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  35.11 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  34.45 
 
 		 685 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  35.79 
 
 		 733 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.83 
 
 		 731 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.59 
 
 		 746 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  35.04 
 
 		 733 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 		 1158 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  35.18 
 
 		 733 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  35.33 
 
 		 748 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  34.78 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  35.99 
 
 		 730 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  35.6 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.21 
 
 		 737 aa  357  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 1338 aa  356  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  34.29 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.55 
 
 		 762 aa  354  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.42 
 
 		 1321 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  35.86 
 
 		 772 aa  346  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.18 
 
 		 724 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.22 
 
 		 790 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  36.04 
 
 		 779 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  33.58 
 
 		 735 aa  336  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  36.32 
 
 		 748 aa  336  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.2 
 
 		 771 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 751 aa  335  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  35.72 
 
 		 751 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  35.72 
 
 		 751 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.31 
 
 		 777 aa  333  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.75 
 
 		 766 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 753 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 		 782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.06 
 
 		 737 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 		 778 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.17 
 
 		 778 aa  328  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 		 743 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  31.97 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 763 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  31.09 
 
 		 819 aa  325  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 805 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.3 
 
 		 829 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 931 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.33 
 
 		 772 aa  323  6e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 		 801 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 		 766 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.74 
 
 		 755 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>