More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2534 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  61.78 
 
 		 809 aa  882    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 813 aa  1625    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  41.92 
 
 		 762 aa  631  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  44.82 
 
 		 800 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  42.12 
 
 		 755 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.68 
 
 		 758 aa  599  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.54 
 
 		 749 aa  600  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.69 
 
 		 790 aa  595  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.32 
 
 		 755 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  47.66 
 
 		 750 aa  591  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.04 
 
 		 757 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  45.36 
 
 		 747 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.07 
 
 		 750 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.06 
 
 		 751 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  48.23 
 
 		 740 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.92 
 
 		 742 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  41.1 
 
 		 741 aa  540  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  49.17 
 
 		 760 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.15 
 
 		 758 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.21 
 
 		 777 aa  538  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.42 
 
 		 748 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  43.84 
 
 		 749 aa  527  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  39.7 
 
 		 874 aa  528  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  41.53 
 
 		 737 aa  524  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  42.73 
 
 		 757 aa  508  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.53 
 
 		 737 aa  475  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.63 
 
 		 780 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  35.64 
 
 		 793 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  35.5 
 
 		 793 aa  422  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 		 814 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  38.7 
 
 		 708 aa  415  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.67 
 
 		 722 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  34.79 
 
 		 721 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  39.63 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  34.71 
 
 		 717 aa  399  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  35.92 
 
 		 721 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  34.3 
 
 		 714 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.41 
 
 		 734 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  35.36 
 
 		 716 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.14 
 
 		 738 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  35.45 
 
 		 731 aa  357  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 		 711 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.61 
 
 		 757 aa  349  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  34.41 
 
 		 733 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  34.41 
 
 		 733 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  34.41 
 
 		 733 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  35.31 
 
 		 922 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  35.17 
 
 		 731 aa  334  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  33.94 
 
 		 733 aa  333  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.07 
 
 		 933 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  35.49 
 
 		 731 aa  331  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  36.96 
 
 		 691 aa  330  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.57 
 
 		 733 aa  327  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  33.8 
 
 		 733 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  38.22 
 
 		 693 aa  324  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  36.14 
 
 		 731 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  33.8 
 
 		 733 aa  323  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.75 
 
 		 737 aa  320  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33 
 
 		 685 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  34.25 
 
 		 748 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 		 1072 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  33.98 
 
 		 730 aa  307  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  34.52 
 
 		 735 aa  300  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  34.21 
 
 		 987 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  34 
 
 		 748 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.7 
 
 		 756 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.19 
 
 		 724 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.49 
 
 		 829 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 1321 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.23 
 
 		 1158 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.21 
 
 		 497 aa  287  5.999999999999999e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.14 
 
 		 814 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  41.16 
 
 		 914 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  32.3 
 
 		 931 aa  281  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  41.53 
 
 		 845 aa  280  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  41.32 
 
 		 915 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.43 
 
 		 1338 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  43.13 
 
 		 818 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.37 
 
 		 822 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  41.3 
 
 		 823 aa  273  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.02 
 
 		 772 aa  272  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 748 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  37.4 
 
 		 839 aa  270  5.9999999999999995e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  33.03 
 
 		 751 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 		 820 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  38.14 
 
 		 851 aa  269  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.86 
 
 		 762 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  32.88 
 
 		 751 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  32.88 
 
 		 751 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  40.79 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.02 
 
 		 760 aa  259  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  37.97 
 
 		 843 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.45 
 
 		 778 aa  257  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  38.84 
 
 		 738 aa  257  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  38.84 
 
 		 738 aa  257  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  39.25 
 
 		 831 aa  257  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.31 
 
 		 778 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.06 
 
 		 783 aa  252  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>