More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1089 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  54.33 
 
 
805 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  100 
 
 
818 aa  1607    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  45.14 
 
 
820 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  45.84 
 
 
832 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.14 
 
 
813 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.54 
 
 
814 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.37 
 
 
874 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  39.33 
 
 
914 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  38.95 
 
 
915 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  39.68 
 
 
823 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.53 
 
 
820 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  37.71 
 
 
845 aa  488  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  35.74 
 
 
833 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  37.68 
 
 
836 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  34.31 
 
 
839 aa  441  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  33.53 
 
 
866 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
887 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  34.26 
 
 
838 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 
831 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  31.82 
 
 
851 aa  416  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  33.17 
 
 
832 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
857 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  32.05 
 
 
843 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  31.79 
 
 
870 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  33.53 
 
 
843 aa  409  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  33.58 
 
 
850 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  33.15 
 
 
738 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  32.58 
 
 
852 aa  379  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  32.88 
 
 
738 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  34.36 
 
 
816 aa  347  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  30.98 
 
 
897 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  34.11 
 
 
897 aa  343  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30.9 
 
 
884 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.76 
 
 
913 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  29.47 
 
 
906 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 
913 aa  336  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  29.53 
 
 
913 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  61.29 
 
 
895 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  30 
 
 
772 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.92 
 
 
749 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.92 
 
 
758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 
755 aa  278  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.5 
 
 
751 aa  277  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.13 
 
 
813 aa  276  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.29 
 
 
757 aa  275  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  30.68 
 
 
966 aa  272  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.3 
 
 
578 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 
755 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  36.34 
 
 
762 aa  267  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  39.63 
 
 
749 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.33 
 
 
750 aa  264  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  36.84 
 
 
714 aa  262  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  42.35 
 
 
708 aa  262  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  42.66 
 
 
740 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 
721 aa  261  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  39.71 
 
 
717 aa  261  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.63 
 
 
748 aa  261  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  37.6 
 
 
747 aa  257  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.19 
 
 
711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  37.24 
 
 
800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.05 
 
 
809 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.43 
 
 
745 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.01 
 
 
742 aa  254  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  37.44 
 
 
721 aa  251  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  40.56 
 
 
750 aa  249  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.87 
 
 
741 aa  249  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  42.56 
 
 
760 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.83 
 
 
722 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
734 aa  246  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  43.03 
 
 
701 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  35.44 
 
 
793 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  35.44 
 
 
793 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  29.55 
 
 
972 aa  240  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 
790 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.93 
 
 
758 aa  237  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  37.77 
 
 
737 aa  236  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  40.23 
 
 
874 aa  233  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  32.36 
 
 
814 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.22 
 
 
737 aa  231  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.2 
 
 
757 aa  228  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 
780 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.54 
 
 
839 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  36.83 
 
 
757 aa  225  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.63 
 
 
777 aa  224  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 
738 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.56 
 
 
746 aa  221  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.88 
 
 
716 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  39.89 
 
 
693 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  30.73 
 
 
902 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.63 
 
 
1072 aa  210  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.05 
 
 
881 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 
724 aa  204  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.9 
 
 
933 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  28.46 
 
 
898 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.96 
 
 
497 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  28.68 
 
 
882 aa  198  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  28.26 
 
 
882 aa  197  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  26.35 
 
 
893 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  34.9 
 
 
727 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.84 
 
 
731 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>