More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4099 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.73 
 
 		 1158 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  67.02 
 
 		 933 aa  1215    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.37 
 
 		 1321 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 1072 aa  2134    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  60.51 
 
 		 987 aa  737    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  47.92 
 
 		 1338 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  43.31 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  37.27 
 
 		 731 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 758 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 749 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.03 
 
 		 755 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  35.15 
 
 		 762 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  36.86 
 
 		 730 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 755 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  37.87 
 
 		 748 aa  412  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  36.92 
 
 		 922 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 		 734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.49 
 
 		 757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  36.77 
 
 		 731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  37.03 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  36.51 
 
 		 748 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  37.03 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  37.03 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  35.89 
 
 		 735 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  36.05 
 
 		 731 aa  396  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  38.97 
 
 		 748 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.4 
 
 		 711 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  38.2 
 
 		 779 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  33.9 
 
 		 738 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.74 
 
 		 790 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  36.44 
 
 		 733 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  38.55 
 
 		 751 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  38.83 
 
 		 751 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  38.55 
 
 		 751 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  34.77 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.75 
 
 		 750 aa  386  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  36.15 
 
 		 733 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.21 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.28 
 
 		 750 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.06 
 
 		 758 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  36.4 
 
 		 760 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  35.46 
 
 		 931 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.7 
 
 		 829 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.22 
 
 		 737 aa  382  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  35.92 
 
 		 733 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.86 
 
 		 741 aa  379  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 740 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  36.07 
 
 		 733 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  31.4 
 
 		 721 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  35.03 
 
 		 800 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  35.48 
 
 		 749 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.09 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  36.64 
 
 		 691 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  37.54 
 
 		 737 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.04 
 
 		 777 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  35.01 
 
 		 731 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  34.61 
 
 		 819 aa  356  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  34.26 
 
 		 685 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  33.95 
 
 		 757 aa  352  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.58 
 
 		 737 aa  350  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.08 
 
 		 809 aa  347  8e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  46.63 
 
 		 927 aa  346  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.77 
 
 		 780 aa  343  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 		 756 aa  342  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 		 751 aa  340  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 793 aa  338  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.66 
 
 		 748 aa  338  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.43 
 
 		 793 aa  337  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 		 721 aa  334  6e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.23 
 
 		 814 aa  332  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.53 
 
 		 746 aa  330  9e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  34.02 
 
 		 822 aa  328  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  31.89 
 
 		 722 aa  327  6e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.2 
 
 		 717 aa  323  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  34.73 
 
 		 737 aa  320  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.89 
 
 		 813 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  32.38 
 
 		 701 aa  318  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.86 
 
 		 716 aa  318  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  32.2 
 
 		 708 aa  315  2.9999999999999996e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  32.68 
 
 		 772 aa  314  6.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.6 
 
 		 762 aa  308  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  28.81 
 
 		 874 aa  308  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  34.27 
 
 		 727 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 772 aa  303  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 		 790 aa  300  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  30.32 
 
 		 714 aa  297  7e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  31.16 
 
 		 759 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.81 
 
 		 754 aa  295  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  29.95 
 
 		 765 aa  293  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 805 aa  289  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.29 
 
 		 807 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.15 
 
 		 778 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  31.1 
 
 		 733 aa  283  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.17 
 
 		 778 aa  283  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.53 
 
 		 743 aa  282  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  30.96 
 
 		 743 aa  281  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  28.8 
 
 		 772 aa  281  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.15 
 
 		 751 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>