More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3540 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  100 
 
 
816 aa  1628    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  39.14 
 
 
832 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.12 
 
 
814 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.77 
 
 
813 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  34.64 
 
 
914 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  33.98 
 
 
915 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  33.78 
 
 
845 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.48 
 
 
820 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  33.46 
 
 
823 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  32.92 
 
 
838 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  32.93 
 
 
852 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 
831 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  31.34 
 
 
833 aa  358  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  31.95 
 
 
850 aa  351  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.07 
 
 
820 aa  347  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.99 
 
 
818 aa  344  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.61 
 
 
874 aa  337  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  29.25 
 
 
843 aa  324  5e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  29.99 
 
 
857 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  30.26 
 
 
843 aa  319  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.99 
 
 
839 aa  318  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  31.69 
 
 
836 aa  316  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.54 
 
 
870 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  28.13 
 
 
887 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  27.93 
 
 
832 aa  284  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.86 
 
 
755 aa  273  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  32.41 
 
 
927 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  28.04 
 
 
913 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  27.95 
 
 
913 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 
913 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.05 
 
 
757 aa  264  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  38.17 
 
 
755 aa  263  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29.65 
 
 
897 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  31.11 
 
 
897 aa  258  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  29.54 
 
 
884 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.41 
 
 
906 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
749 aa  253  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
758 aa  252  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  40.91 
 
 
750 aa  248  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  42.22 
 
 
805 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
711 aa  243  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
894 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  36.07 
 
 
762 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  37.98 
 
 
839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  37.43 
 
 
741 aa  240  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  40.75 
 
 
740 aa  240  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.5 
 
 
742 aa  237  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.74 
 
 
966 aa  236  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  28.29 
 
 
772 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.89 
 
 
813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  39.33 
 
 
749 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.43 
 
 
748 aa  234  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.75 
 
 
751 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  38.94 
 
 
738 aa  234  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  42.97 
 
 
760 aa  234  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.79 
 
 
750 aa  234  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  47.91 
 
 
895 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  38.64 
 
 
738 aa  232  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.2 
 
 
790 aa  231  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.74 
 
 
757 aa  229  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.37 
 
 
777 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.16 
 
 
758 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.49 
 
 
737 aa  228  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  36.17 
 
 
851 aa  221  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.99 
 
 
737 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.32 
 
 
734 aa  218  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  39.02 
 
 
722 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  37.34 
 
 
717 aa  217  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  36.07 
 
 
721 aa  217  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.83 
 
 
745 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  38.61 
 
 
721 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.76 
 
 
809 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  34.28 
 
 
747 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  40.94 
 
 
701 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  37.58 
 
 
714 aa  213  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  38.91 
 
 
708 aa  210  9e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  36.76 
 
 
716 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  34.25 
 
 
800 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  33.14 
 
 
814 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  39.65 
 
 
578 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  27.67 
 
 
904 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.42 
 
 
738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  32.46 
 
 
793 aa  202  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 
793 aa  201  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  27.93 
 
 
881 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 
780 aa  197  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  34.57 
 
 
874 aa  193  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  26.12 
 
 
864 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  32.64 
 
 
866 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.36 
 
 
927 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  37.58 
 
 
549 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  37.58 
 
 
731 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  37.58 
 
 
922 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.17 
 
 
746 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.07 
 
 
933 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.54 
 
 
757 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  27.94 
 
 
882 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  32.44 
 
 
731 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  27.56 
 
 
882 aa  178  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  37.62 
 
 
731 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>