More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1217 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
966 aa  1962    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  39.19 
 
 
886 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.22 
 
 
904 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  35.65 
 
 
914 aa  432  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  34.62 
 
 
915 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.66 
 
 
756 aa  412  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  33.93 
 
 
881 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  34.49 
 
 
831 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  34.93 
 
 
882 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 
814 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  33.18 
 
 
893 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  32.96 
 
 
902 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  34.68 
 
 
882 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.79 
 
 
875 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  31.87 
 
 
866 aa  354  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  33.11 
 
 
889 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  33.09 
 
 
823 aa  353  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  31.55 
 
 
864 aa  350  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.45 
 
 
820 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  44.19 
 
 
778 aa  347  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  43.41 
 
 
777 aa  347  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  35.21 
 
 
898 aa  344  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.97 
 
 
762 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  43.15 
 
 
778 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  33.92 
 
 
849 aa  332  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  30.24 
 
 
857 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  40.04 
 
 
805 aa  331  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.18 
 
 
792 aa  328  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  30.07 
 
 
832 aa  324  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  31.29 
 
 
913 aa  321  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  43.71 
 
 
772 aa  319  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  29.59 
 
 
887 aa  320  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.83 
 
 
795 aa  317  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.62 
 
 
870 aa  317  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  43.47 
 
 
790 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  31.13 
 
 
913 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 
913 aa  314  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  31.17 
 
 
897 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.06 
 
 
807 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  32.23 
 
 
833 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  29.69 
 
 
843 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.04 
 
 
784 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  30.81 
 
 
845 aa  304  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.19 
 
 
782 aa  302  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.78 
 
 
771 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30.94 
 
 
884 aa  301  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  31.31 
 
 
839 aa  301  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  30.08 
 
 
851 aa  300  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  31.41 
 
 
906 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  31.45 
 
 
843 aa  298  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  30.95 
 
 
836 aa  298  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  31.47 
 
 
934 aa  297  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  32.89 
 
 
927 aa  297  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  37.53 
 
 
859 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.27 
 
 
783 aa  294  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  30.98 
 
 
850 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.64 
 
 
755 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  32.47 
 
 
838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  38.68 
 
 
788 aa  281  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.24 
 
 
839 aa  279  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  37.83 
 
 
808 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  30.58 
 
 
772 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  37.87 
 
 
802 aa  274  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.61 
 
 
760 aa  271  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  29.33 
 
 
897 aa  271  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.13 
 
 
801 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.19 
 
 
806 aa  264  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  31.55 
 
 
805 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.62 
 
 
757 aa  262  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.19 
 
 
773 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  29.68 
 
 
738 aa  259  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.68 
 
 
818 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  37.01 
 
 
817 aa  258  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  30.56 
 
 
832 aa  256  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  37.47 
 
 
811 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  29.43 
 
 
738 aa  253  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.18 
 
 
754 aa  252  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  35.14 
 
 
743 aa  250  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.59 
 
 
807 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  37.68 
 
 
737 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.93 
 
 
902 aa  247  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  35.92 
 
 
1037 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.75 
 
 
771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.79 
 
 
769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.71 
 
 
799 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.74 
 
 
778 aa  244  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.74 
 
 
785 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  35.87 
 
 
787 aa  242  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.09 
 
 
760 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.95 
 
 
809 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.67 
 
 
760 aa  241  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.24 
 
 
760 aa  240  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36 
 
 
762 aa  240  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.49 
 
 
765 aa  239  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.89 
 
 
742 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.9 
 
 
804 aa  238  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  35.49 
 
 
751 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 
765 aa  238  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.82 
 
 
791 aa  237  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  29.73 
 
 
852 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>