More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2404 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  100 
 
 		 898 aa  1805    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  45.65 
 
 		 882 aa  668    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  42.26 
 
 		 902 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  47.79 
 
 		 881 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  45.77 
 
 		 882 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.15 
 
 		 889 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.3 
 
 		 904 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  40.16 
 
 		 893 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  39.72 
 
 		 875 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  42.96 
 
 		 849 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  35.66 
 
 		 864 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.18 
 
 		 886 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  35.21 
 
 		 966 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  43.72 
 
 		 717 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.94 
 
 		 988 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.09 
 
 		 972 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.71 
 
 		 712 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  44.16 
 
 		 905 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  40.75 
 
 		 733 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 831 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.14 
 
 		 914 aa  281  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.98 
 
 		 814 aa  280  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  30.48 
 
 		 915 aa  272  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.15 
 
 		 839 aa  268  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  30.88 
 
 		 897 aa  265  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  31.32 
 
 		 927 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  38.29 
 
 		 763 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  28.83 
 
 		 857 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  28.18 
 
 		 823 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  28.78 
 
 		 866 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 913 aa  240  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  26.52 
 
 		 913 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 820 aa  235  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  26.89 
 
 		 913 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  27.42 
 
 		 906 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  28 
 
 		 838 aa  234  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  27.97 
 
 		 897 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  28.21 
 
 		 772 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  27.33 
 
 		 851 aa  232  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  27.09 
 
 		 870 aa  230  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  33.72 
 
 		 803 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  27.02 
 
 		 839 aa  226  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  25.96 
 
 		 843 aa  226  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  26.4 
 
 		 843 aa  223  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.42 
 
 		 1212 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  38.54 
 
 		 928 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  26.63 
 
 		 845 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  37.2 
 
 		 874 aa  220  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  25.97 
 
 		 887 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  27.78 
 
 		 738 aa  218  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.17 
 
 		 762 aa  218  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  27.07 
 
 		 738 aa  217  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  30.52 
 
 		 832 aa  217  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  37.87 
 
 		 777 aa  214  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.82 
 
 		 923 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.09 
 
 		 927 aa  211  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  28.13 
 
 		 852 aa  211  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  26.62 
 
 		 832 aa  210  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  27.2 
 
 		 884 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  37.25 
 
 		 778 aa  210  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  37.25 
 
 		 778 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  27.63 
 
 		 850 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  26.65 
 
 		 833 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.21 
 
 		 851 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 894 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  37.56 
 
 		 952 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 805 aa  207  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.53 
 
 		 782 aa  207  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.99 
 
 		 771 aa  205  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.53 
 
 		 1548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  27.78 
 
 		 818 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.67 
 
 		 974 aa  201  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  36.61 
 
 		 811 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  37.53 
 
 		 934 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.64 
 
 		 1343 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.32 
 
 		 760 aa  194  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  41.79 
 
 		 768 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.08 
 
 		 756 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.07 
 
 		 824 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.03 
 
 		 792 aa  191  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.53 
 
 		 755 aa  191  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  33.9 
 
 		 949 aa  191  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  41.54 
 
 		 764 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.69 
 
 		 772 aa  190  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  40.3 
 
 		 763 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 		 772 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.77 
 
 		 769 aa  190  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  36.32 
 
 		 875 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  41.15 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 		 754 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  39.93 
 
 		 763 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  39.93 
 
 		 763 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  38.37 
 
 		 802 aa  187  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  39.49 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  35.91 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  35.85 
 
 		 790 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.64 
 
 		 807 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.58 
 
 		 1357 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.25 
 
 		 773 aa  184  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.64 
 
 		 762 aa  182  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>