More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1318 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  46.51 
 
 
928 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  47.98 
 
 
949 aa  720    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  55.27 
 
 
974 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  44.78 
 
 
934 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  100 
 
 
952 aa  1843    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  55.79 
 
 
874 aa  778    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.07 
 
 
972 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.34 
 
 
923 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  41.05 
 
 
988 aa  618  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  46.32 
 
 
811 aa  592  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  47.12 
 
 
875 aa  592  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  42.62 
 
 
999 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.43 
 
 
824 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.73 
 
 
851 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.23 
 
 
927 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  29.71 
 
 
972 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.51 
 
 
881 aa  296  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  38.52 
 
 
893 aa  234  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  37.56 
 
 
902 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  38.33 
 
 
905 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.04 
 
 
889 aa  218  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  40.25 
 
 
849 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  39.28 
 
 
882 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  38.18 
 
 
882 aa  213  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35 
 
 
712 aa  211  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  37.16 
 
 
747 aa  211  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  34.81 
 
 
864 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  37.56 
 
 
898 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.55 
 
 
904 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  30.3 
 
 
823 aa  200  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  32.07 
 
 
717 aa  191  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  31.95 
 
 
733 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.49 
 
 
820 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  33.77 
 
 
875 aa  187  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  26.25 
 
 
866 aa  187  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.06 
 
 
762 aa  178  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  25.14 
 
 
870 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.55 
 
 
782 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  34.13 
 
 
966 aa  173  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  24.29 
 
 
886 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  26.69 
 
 
850 aa  165  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.21 
 
 
1548 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.26 
 
 
1212 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  33.05 
 
 
777 aa  163  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.58 
 
 
778 aa  161  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.41 
 
 
1357 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 
805 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.76 
 
 
792 aa  159  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  32.26 
 
 
763 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.32 
 
 
784 aa  156  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.87 
 
 
778 aa  156  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.66 
 
 
1343 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.78 
 
 
772 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.98 
 
 
808 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.95 
 
 
760 aa  152  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.48 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  24.37 
 
 
843 aa  146  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 
795 aa  145  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  35.57 
 
 
790 aa  145  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.75 
 
 
806 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 
760 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 
755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  29.31 
 
 
772 aa  142  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  30 
 
 
765 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  30 
 
 
765 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.76 
 
 
756 aa  141  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  30 
 
 
765 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  30 
 
 
765 aa  141  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  29.75 
 
 
765 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 
760 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.86 
 
 
778 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  29.75 
 
 
765 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.96 
 
 
737 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.75 
 
 
765 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 
757 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  29.75 
 
 
765 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  29.75 
 
 
765 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 
1037 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.57 
 
 
738 aa  137  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.03 
 
 
785 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  28.57 
 
 
755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  28.97 
 
 
765 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  31.43 
 
 
817 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  28.57 
 
 
755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  28.97 
 
 
755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.63 
 
 
769 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  28.57 
 
 
755 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  30.53 
 
 
745 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.58 
 
 
760 aa  134  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.5 
 
 
773 aa  134  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 
769 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 
763 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  31.34 
 
 
788 aa  132  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  31.2 
 
 
763 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 
914 aa  131  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 
763 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.56 
 
 
798 aa  131  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  28.88 
 
 
803 aa  130  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.96 
 
 
763 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.21 
 
 
902 aa  130  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>