More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1295 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  64.51 
 
 
928 aa  1121    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  70.41 
 
 
934 aa  1255    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  57.46 
 
 
999 aa  995    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  51.22 
 
 
988 aa  860    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  100 
 
 
923 aa  1840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  53.5 
 
 
875 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.19 
 
 
824 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  47.36 
 
 
811 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  44.17 
 
 
952 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.44 
 
 
974 aa  594  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  46.27 
 
 
874 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35 
 
 
927 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  42.05 
 
 
949 aa  567  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.69 
 
 
972 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  35.27 
 
 
972 aa  519  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.59 
 
 
851 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  33.22 
 
 
904 aa  346  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.75 
 
 
875 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  31.78 
 
 
881 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.26 
 
 
814 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  34.98 
 
 
849 aa  302  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 
966 aa  293  9e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.96 
 
 
886 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  39.52 
 
 
747 aa  244  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
831 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  29.54 
 
 
823 aa  242  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  39.95 
 
 
893 aa  240  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.17 
 
 
866 aa  238  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  27.78 
 
 
857 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.86 
 
 
734 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.65 
 
 
712 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  30.07 
 
 
787 aa  223  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  35.43 
 
 
902 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  27.66 
 
 
845 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  36.66 
 
 
905 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.62 
 
 
1212 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.96 
 
 
889 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  39.36 
 
 
898 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  34.98 
 
 
864 aa  203  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  37.23 
 
 
733 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.4 
 
 
839 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
913 aa  188  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  35.4 
 
 
882 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.96 
 
 
1357 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  32.28 
 
 
1548 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  35.19 
 
 
882 aa  184  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.78 
 
 
777 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 
778 aa  178  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.61 
 
 
1343 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
902 aa  177  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.18 
 
 
860 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.46 
 
 
782 aa  175  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  31 
 
 
717 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
760 aa  174  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.86 
 
 
755 aa  174  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.7 
 
 
778 aa  172  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 
805 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  36.1 
 
 
765 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.17 
 
 
762 aa  168  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  37.62 
 
 
914 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  28.64 
 
 
731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  35.56 
 
 
870 aa  165  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  35.4 
 
 
772 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.23 
 
 
756 aa  163  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.75 
 
 
765 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  37.3 
 
 
832 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.09 
 
 
795 aa  162  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  37.12 
 
 
915 aa  161  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  34.69 
 
 
843 aa  157  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.64 
 
 
739 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 
755 aa  157  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 
749 aa  157  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.68 
 
 
763 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  30.89 
 
 
887 aa  156  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 
771 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  34.93 
 
 
737 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 
808 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  33.22 
 
 
762 aa  154  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.91 
 
 
792 aa  152  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.21 
 
 
743 aa  152  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  35.15 
 
 
913 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  34.81 
 
 
913 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  34.69 
 
 
843 aa  151  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.31 
 
 
769 aa  150  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  29.83 
 
 
618 aa  150  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  25.62 
 
 
884 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.93 
 
 
759 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.02 
 
 
760 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 
765 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.78 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  38.15 
 
 
802 aa  150  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  35.84 
 
 
740 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  35.29 
 
 
716 aa  149  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.23 
 
 
737 aa  148  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  41.2 
 
 
693 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.87 
 
 
736 aa  147  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  37.45 
 
 
790 aa  147  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.55 
 
 
777 aa  147  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.25 
 
 
742 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.84 
 
 
763 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>