More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  46.75 
 
 		 934 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  51.74 
 
 		 949 aa  847    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  54.88 
 
 		 874 aa  790    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 974 aa  1899    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  55.27 
 
 		 952 aa  817    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.29 
 
 		 972 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  46.51 
 
 		 811 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  42.73 
 
 		 988 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.44 
 
 		 923 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  45.01 
 
 		 928 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  46.51 
 
 		 875 aa  589  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.84 
 
 		 824 aa  585  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  41.89 
 
 		 999 aa  542  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.74 
 
 		 851 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.25 
 
 		 927 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  32.4 
 
 		 972 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.37 
 
 		 881 aa  284  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  31.69 
 
 		 882 aa  275  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  26.47 
 
 		 864 aa  260  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  31.74 
 
 		 849 aa  253  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  25.12 
 
 		 875 aa  227  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.68 
 
 		 889 aa  217  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  36.5 
 
 		 902 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.47 
 
 		 904 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 712 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  27.9 
 
 		 823 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 893 aa  201  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  36.41 
 
 		 882 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  34.06 
 
 		 905 aa  200  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  34.67 
 
 		 898 aa  194  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 		 717 aa  193  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  36.68 
 
 		 747 aa  193  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.05 
 
 		 784 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.05 
 
 		 1212 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  32.01 
 
 		 733 aa  178  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  23.91 
 
 		 857 aa  171  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  24.97 
 
 		 843 aa  168  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.42 
 
 		 1343 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  25.34 
 
 		 843 aa  160  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  29.54 
 
 		 1548 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.38 
 
 		 1357 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  25.68 
 
 		 886 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  30.95 
 
 		 803 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  34.7 
 
 		 966 aa  156  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  32.34 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.86 
 
 		 762 aa  148  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.08 
 
 		 778 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  24.75 
 
 		 906 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 1037 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  34.74 
 
 		 914 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.84 
 
 		 771 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.43 
 
 		 777 aa  139  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.26 
 
 		 742 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 795 aa  138  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  33.95 
 
 		 915 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.51 
 
 		 782 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.96 
 
 		 804 aa  135  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.57 
 
 		 752 aa  135  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  34.58 
 
 		 817 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.87 
 
 		 820 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.58 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 		 738 aa  134  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.12 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.59 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.53 
 
 		 760 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.88 
 
 		 785 aa  130  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.29 
 
 		 778 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  33.06 
 
 		 723 aa  129  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 		 750 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 769 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 755 aa  128  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.03 
 
 		 778 aa  127  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 		 805 aa  127  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  28.52 
 
 		 745 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.94 
 
 		 762 aa  126  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.88 
 
 		 814 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.2 
 
 		 806 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  31.65 
 
 		 685 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 		 831 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.88 
 
 		 803 aa  125  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  27.37 
 
 		 743 aa  124  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.57 
 
 		 772 aa  124  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  31.68 
 
 		 845 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  33.69 
 
 		 763 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 757 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  29.84 
 
 		 721 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  31.05 
 
 		 750 aa  123  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.03 
 
 		 787 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.7 
 
 		 792 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.25 
 
 		 773 aa  122  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.54 
 
 		 756 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.62 
 
 		 740 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 		 757 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.5 
 
 		 902 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.07 
 
 		 745 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.84 
 
 		 724 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  31.95 
 
 		 749 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  29.63 
 
 		 722 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.26 
 
 		 766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>