More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5566 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  55.1 
 
 		 934 aa  963    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  57.65 
 
 		 928 aa  1013    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  44.83 
 
 		 988 aa  727    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  57.46 
 
 		 923 aa  990    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  100 
 
 		 999 aa  1949    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  46.09 
 
 		 875 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  42.42 
 
 		 952 aa  545  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  44.03 
 
 		 874 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.89 
 
 		 974 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.9 
 
 		 927 aa  528  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.29 
 
 		 824 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  42.17 
 
 		 811 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  38.66 
 
 		 949 aa  516  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.23 
 
 		 972 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.49 
 
 		 851 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  33.3 
 
 		 972 aa  485  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 		 875 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  31.46 
 
 		 881 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  31.43 
 
 		 882 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  31.57 
 
 		 882 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  30.08 
 
 		 966 aa  270  8.999999999999999e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.33 
 
 		 814 aa  270  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  34.02 
 
 		 849 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  30.88 
 
 		 915 aa  259  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  38.14 
 
 		 747 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  25.95 
 
 		 870 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  34.97 
 
 		 893 aa  205  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  26.06 
 
 		 851 aa  204  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  31.7 
 
 		 902 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.29 
 
 		 712 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.79 
 
 		 914 aa  181  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  40.79 
 
 		 904 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.96 
 
 		 889 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  39.29 
 
 		 905 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  30.24 
 
 		 864 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.03 
 
 		 755 aa  167  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  34.43 
 
 		 898 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.48 
 
 		 902 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  35.79 
 
 		 857 aa  163  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.15 
 
 		 762 aa  161  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  44.19 
 
 		 895 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.84 
 
 		 766 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37 
 
 		 1357 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 		 777 aa  157  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  35.36 
 
 		 866 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  30.25 
 
 		 733 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 		 755 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  37.97 
 
 		 1037 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  34.21 
 
 		 765 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.99 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.46 
 
 		 782 aa  155  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.99 
 
 		 1212 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.09 
 
 		 795 aa  155  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  37.01 
 
 		 823 aa  154  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  36.75 
 
 		 778 aa  154  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  36.4 
 
 		 778 aa  153  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.46 
 
 		 799 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.43 
 
 		 807 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  28.8 
 
 		 843 aa  152  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  37.45 
 
 		 886 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  35.74 
 
 		 766 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.63 
 
 		 820 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 805 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  36.59 
 
 		 790 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.79 
 
 		 760 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.91 
 
 		 760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  34.35 
 
 		 772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.21 
 
 		 749 aa  148  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.98 
 
 		 751 aa  148  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  32.98 
 
 		 762 aa  147  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  31.05 
 
 		 721 aa  147  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 765 aa  146  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  31.97 
 
 		 765 aa  147  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  31.97 
 
 		 765 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  29.26 
 
 		 787 aa  147  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.97 
 
 		 765 aa  146  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  31.97 
 
 		 765 aa  146  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  31.97 
 
 		 765 aa  146  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 		 1158 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  31.97 
 
 		 765 aa  146  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 		 765 aa  146  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  31.72 
 
 		 745 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.97 
 
 		 765 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.02 
 
 		 771 aa  145  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  31.97 
 
 		 755 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  34.4 
 
 		 832 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.58 
 
 		 774 aa  145  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  32.35 
 
 		 817 aa  144  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  30.92 
 
 		 772 aa  144  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.19 
 
 		 785 aa  144  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.45 
 
 		 783 aa  144  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.49 
 
 		 759 aa  144  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  31.6 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.6 
 
 		 755 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.64 
 
 		 813 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.45 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.84 
 
 		 756 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  31.14 
 
 		 717 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>