More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4940 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  65.08 
 
 		 824 aa  958    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  100 
 
 		 811 aa  1637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  48.9 
 
 		 875 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  46.3 
 
 		 874 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  46.21 
 
 		 974 aa  625  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  47.52 
 
 		 934 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  46.72 
 
 		 923 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  45.5 
 
 		 928 aa  608  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  44.87 
 
 		 988 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  43.86 
 
 		 949 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  46.21 
 
 		 952 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.55 
 
 		 927 aa  558  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  42.24 
 
 		 999 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.82 
 
 		 972 aa  515  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  35.81 
 
 		 972 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.59 
 
 		 851 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  32.37 
 
 		 881 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.14 
 
 		 875 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  28.76 
 
 		 864 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.37 
 
 		 777 aa  237  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.64 
 
 		 814 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  26.61 
 
 		 721 aa  229  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  36.65 
 
 		 905 aa  217  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  26.78 
 
 		 866 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  25.87 
 
 		 887 aa  214  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.34 
 
 		 889 aa  208  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  37.85 
 
 		 733 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  27.64 
 
 		 823 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.45 
 
 		 712 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  37.2 
 
 		 882 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  36.66 
 
 		 882 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  36.6 
 
 		 898 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  37.04 
 
 		 893 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.41 
 
 		 820 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  35.01 
 
 		 747 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  33.41 
 
 		 902 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.25 
 
 		 904 aa  188  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  30.25 
 
 		 927 aa  187  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.76 
 
 		 795 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  32.68 
 
 		 717 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  25.91 
 
 		 839 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.2 
 
 		 1548 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  37.22 
 
 		 857 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.68 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 		 1212 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  34.6 
 
 		 765 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  34.32 
 
 		 870 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.45 
 
 		 1357 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  37.27 
 
 		 759 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.74 
 
 		 902 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 		 755 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  36.59 
 
 		 966 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.68 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  36.06 
 
 		 774 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  34.59 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.54 
 
 		 755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  25.81 
 
 		 884 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  38.58 
 
 		 914 aa  148  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.21 
 
 		 763 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.37 
 
 		 743 aa  147  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  34.72 
 
 		 832 aa  147  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.21 
 
 		 763 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  37.85 
 
 		 915 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 758 aa  145  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.59 
 
 		 1343 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.61 
 
 		 751 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.96 
 
 		 756 aa  145  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 749 aa  145  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.03 
 
 		 762 aa  145  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.14 
 
 		 760 aa  144  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  32.35 
 
 		 762 aa  144  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.66 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.73 
 
 		 766 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 763 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 805 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  38.65 
 
 		 759 aa  141  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.54 
 
 		 768 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.53 
 
 		 778 aa  140  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 		 836 aa  140  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.87 
 
 		 886 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  34.36 
 
 		 931 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  36.76 
 
 		 895 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.87 
 
 		 733 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.39 
 
 		 777 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  30.87 
 
 		 772 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  38.29 
 
 		 1037 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.21 
 
 		 755 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.21 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.36 
 
 		 771 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  33.58 
 
 		 716 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.23 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.75 
 
 		 807 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 		 734 aa  137  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  34.83 
 
 		 808 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  31.88 
 
 		 755 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.94 
 
 		 782 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  32.51 
 
 		 800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>