More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3874 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  100 
 
 
864 aa  1790    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  43.6 
 
 
875 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  39.48 
 
 
904 aa  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  39.68 
 
 
893 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  38.9 
 
 
881 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  39.07 
 
 
902 aa  562  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.53 
 
 
889 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  34.59 
 
 
882 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  34.6 
 
 
882 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  35.77 
 
 
898 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  33.86 
 
 
849 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  46.21 
 
 
733 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50 
 
 
712 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  30.97 
 
 
886 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  43.91 
 
 
717 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 
966 aa  350  5e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  35.77 
 
 
905 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  28.69 
 
 
934 aa  312  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 
831 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  30.18 
 
 
914 aa  297  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  28.29 
 
 
915 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.07 
 
 
866 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  26.64 
 
 
913 aa  274  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  28.2 
 
 
839 aa  262  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  25.95 
 
 
913 aa  260  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.28 
 
 
906 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.87 
 
 
814 aa  251  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  27.63 
 
 
772 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  26.38 
 
 
949 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
913 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 
927 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  26.58 
 
 
870 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  26.46 
 
 
832 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  26.36 
 
 
897 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  26.82 
 
 
887 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  28.36 
 
 
851 aa  239  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  26.88 
 
 
843 aa  238  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  26.83 
 
 
884 aa  237  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  26.08 
 
 
857 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  26.59 
 
 
823 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  27.49 
 
 
843 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.84 
 
 
762 aa  233  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.42 
 
 
820 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  36.32 
 
 
763 aa  230  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
805 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  26.15 
 
 
845 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  34.2 
 
 
803 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 
756 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  32.87 
 
 
874 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
972 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  34.77 
 
 
778 aa  213  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.27 
 
 
772 aa  212  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  36.95 
 
 
777 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  27.53 
 
 
738 aa  212  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 
778 aa  212  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.7 
 
 
1212 aa  210  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  37.54 
 
 
790 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  35.52 
 
 
875 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  27.28 
 
 
738 aa  208  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  33.26 
 
 
928 aa  207  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.93 
 
 
1343 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
988 aa  205  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.24 
 
 
1548 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.13 
 
 
1357 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.98 
 
 
923 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  33.58 
 
 
765 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.58 
 
 
755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.68 
 
 
765 aa  201  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.68 
 
 
765 aa  201  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.68 
 
 
765 aa  201  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.68 
 
 
765 aa  201  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.22 
 
 
807 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.02 
 
 
974 aa  200  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.33 
 
 
755 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  33.33 
 
 
755 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.68 
 
 
772 aa  200  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.54 
 
 
768 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.33 
 
 
755 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
782 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  34.81 
 
 
952 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 
765 aa  198  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.44 
 
 
765 aa  198  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.44 
 
 
765 aa  198  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.05 
 
 
792 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  26.18 
 
 
833 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.44 
 
 
765 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.44 
 
 
765 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.58 
 
 
774 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  30.13 
 
 
765 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.21 
 
 
784 aa  194  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.76 
 
 
734 aa  192  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 
799 aa  191  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 
763 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  31.22 
 
 
765 aa  190  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.33 
 
 
808 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  31.07 
 
 
763 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  25.81 
 
 
816 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  30.39 
 
 
737 aa  189  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.64 
 
 
795 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  31.07 
 
 
763 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>